Basic Information

Symbol
GIMAP4
RNA class
mRNA
Alias
GTPase, IMAP Family Member 4 IMAP4 IAN1 Immune-Associated Nucleotide-Binding Protein 1 Immunity-Associated Nucleotide 1 Protein GTPase IMAP Family Member 4 FLJ11110 HIMAP4 IAN-1 Human Immune Associated Nucleotide 1 Immunity Associated Protein 4 Immunity-Associated Protein 4 MSTP062 HIAN1
Location (GRCh38)
7:150567242-150573962
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018326.3
Sequence length
1945.0 nt
GC content
0.4237

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-528.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -571.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 372.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001363532.2 NCBI
AGUAUUGUGUGCAAAAUCAGAGAGGGGUGCAAGAUCCUGAUUUUUCAGG… 1987 nt 0.4283
NM_018326.3 NCBI
AGUAUUGUGUGCAAAAUCAGAGAGGGGUGCAAGAUCCUGAUUUUUCAGG… 1945 nt 0.4237
Summary

This gene encodes a protein belonging to the GTP-binding superfamily and to the immuno-associated nucleotide (IAN) subfamily of nucleotide-binding proteins. The encoded protein of this gene may be negatively regulated by T-cell acute lymphocytic leukemia 1 (TAL1). In humans, the IAN subfamily genes are located in a cluster at 7q36.1. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans and rats demonstrated that the GIMAP4 is a diagnostic biomarker for myocardial infarction, identified as one of six hub genes used to build a diagnostic nomogram [Wei et al. DOI:10.3389/fimmu.2022.1061800].