Basic Information

Symbol
GIMAP6
RNA class
mRNA
Alias
GTPase, IMAP Family Member 6 IAN6 Immune-Associated Nucleotide-Binding Protein 6 GTPase IMAP Family Member 6 FLJ22690 IAN-2 IAN-6 IAN2 Immunity-Associated Nucleotide 2 Protein Immunity-Associated Nucleotide 6 Protein Immune Associated Nucleotide 2 Immune Associated Nucleotide 6 HIAN2 HIAN6
Location (GRCh38)
7:150625375-150632648
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024711.6
Sequence length
3440.0 nt
GC content
0.4962

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1195.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1260.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1131.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001244071.2 NCBI
ACUUCCUGUUCCUCCAUCUCCAGCGGACACUGCUCUUUCAAGGGCAGGU… 3216 nt 0.4919
NM_001244072.2 NCBI
ACUUCCUGUUCCUCCAUCUCCAGCGGACACUGCUCUUUCAAGGGCAGGU… 3650 nt 0.4997
NM_024711.6 NCBI
ACUUCCUGUUCCUCCAUCUCCAGCGGACACUGCUCUUUCAAGGGCAGGU… 3440 nt 0.4962
Summary

This gene encodes a member of the GTPases of immunity-associated proteins (GIMAP) family. GIMAP proteins contain GTP-binding and coiled-coil motifs, and may play roles in the regulation of cell survival. Decreased expression of this gene may play a role in non-small cell lung cancer. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene, which is found in a cluster with seven additional GIMAP genes on the long arm of chromosome 7. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

A longitudinal mRNA expression analysis in human post-mortem blood samples demonstrated that the GIMAP6 is down-regulated after death and was incorporated into a post-mortem interval (PMI) prediction model with a negative coefficient, where the model achieved a root mean square error of 4.75 hours [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z]. Separately, a study in humans and mice identified the GIMAP6 as a significantly down-regulated clinical diagnostic biomarker in acute myocardial infarction, showing cell-type-specific expression in endothelial cells and macrophages [Li et al. DOI:10.1038/s41598-025-94820-6].