Basic Information

Symbol
GIPC1
RNA class
mRNA
Alias
GIPC PDZ Domain Containing Family Member 1 TIP-2 GIPC GLUT1CBP SYNECTIN RGS19IP1 Hs.6454 C19orf3 SEMCAP NIP Regulator Of G-Protein Signalling 19 Interacting Protein 1 PDZ Domain-Containing Protein GIPC1 GAIP C-Terminus-Interacting Protein RGS-GAIP-Interacting Protein RGS19-Interacting Protein 1 Tax Interaction Protein 2 GIPC PDZ Domain Containing Family, Member 1 IGF-1 Receptor Interacting Protein 1 Chromosome 19 Open Reading Frame 3 GLUT1 C-Terminal Binding Protein SYNECTIIN Synectin IIP-1 OPDM2
Location (GRCh38)
19:14477759-14496157
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005716.4
Sequence length
1921.0 nt
GC content
0.6455

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-910.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -939.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 521.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005716.4 NCBI
GGUCUGGAGUUUGCGGAGGGCCGAGCCGGGUGCGCACGGGGAGGCGGAG… 1921 nt 0.6455
NM_202468.3 NCBI
GGUCUGGAGUUUGCGGAGGGCCGAGCCGGGUGCGCACGGGGAGGCGGAG… 1865 nt 0.6483
NM_202469.3 NCBI
GGUCUGGAGUUUGCGGAGGGCCGAGCCGGGUGCGCACGGGGAGGCGGAG… 1547 nt 0.6399
NM_202470.3 NCBI
GGUCUGGAGUUUGCGGAGGGCCGAGCCGGGUGCGCACGGGGAGGCGGAG… 1777 nt 0.6528
NM_202494.3 NCBI
GGUCUGGAGUUUGCGGAGGGCCGAGCCGGGUGCGCACGGGGAGGCGGAG… 1459 nt 0.6450
Summary

GIPC1 is a scaffolding protein that regulates cell surface receptor expression and trafficking (Lee et al., 2008 [PubMed 18775991]).[supplied by OMIM, Apr 2009]

Forensic Context

A review of human postmortem brain studies found that the GIPC1 is up-regulated in an alcohol-responsive gene module in the frontal cortex of individuals with alcohol use disorder [Warden & Mayfield 10.1016/J.Neuropharm.2017.02.017].