Basic Information

Symbol
GIT1
RNA class
mRNA
Alias
GIT ArfGAP 1 G Protein-Coupled Receptor Kinase Interacting ArfGAP 1 Cool-Associated And Tyrosine-Phosphorylated Protein 1 G Protein-Coupled Receptor Kinase-Interactor 1 ARF GTPase-Activating Protein GIT1 GRK-Interacting Protein 1 ARF GAP GIT1 P95-APP1 CAT-1 CAT1 G Protein-Coupled Receptor Kinase Interactor 1
Location (GRCh38)
17:29573475-29594054
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014030.4
Sequence length
3783.0 nt
GC content
0.6305

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1676.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1738.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1019.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((.....)))))(((((((((((.(((((..((((.(.(((((.((((((((((((((((.((((((.(...((((((((((((((((((((((.(((((((....((((((((...(((((((.((((.((((((((((((((.((((((((..(((((.((....)).))))).)))....)))))..))).)).))))).)))).)))).)))).))).....)))))))).(((((((((((((((((.(....((((..((((((.(..((((((.(.((.((.(((((((((...((((.(((((......((((.((.((((.((((..((((((((((...(((((....((.((((........))))))..(((((((.((((.((.((((((((((..(((((.((((..(((((..(((....))))))))..)).)).)))))....(((((((((((..((((....((((.....))))...)))))))))).....((((((((((..(((((..(((.....)))..)).....(((.................))).......(((.((........)).)))))).)))))))))).))))).((((....)))).)))))))))).....((...........))..............(((((((((((((.((........).).)))))))))..))))....)))))))))))))...((((((.......)))))).)))))))))))))))..)))).)))).)).))))....(((((((((((......)))))))))))..((((((......))))))((((..((((((((........)))))))).....)))).(((.((((((((..(((((.(((...((((((((((...(((..((((((((...(((((((((.((..(((((....))))).)).)))))).)))...............((((........))))((((.((.((((..((..(((((..((((((..(((..........((((.((((.((((.(((...(((((((.......(((((...(((.((..((((((((((((.((.....))...((((...((((((((((((............)))..(((((((((((.(((.((.((...)).))...)))))))))..))))).....)))))))))...)))).(((((...(((((......)))))..))))).........)))))))).))))..)).)))...)))))(((..((.......))..))))))))))((.((((((((.(((((((..(((((..((((((.(((.(((...(((.(((((.((.....((((.((.....)))))).....)).))))).)))......((.(((..(((...)))..))).))...(((.....))))))))).))...))))..)))))..)))))))..))))))))..)).)))..)))).)))).))))......)))..))))))..)))))))..))))))))))))))))))..)))))))..))))))...)).).))))).(((((((((..((.((.........((((((((.......)))))))))))))))))))))......))))))).).))).((((....))))...(((.(.......).)))..)))))...))))..))))))))).(((((...((((((.................))))))....)))))....)).)).).))))))..).))))))..))))).))))))))))))))))).....((((((((.((((((......)).)))))))))))).....))))))))))).......((((......))))))))))))..))).)))))))..).)))))).)))))).))))))))))((((....)))).)))))..).)).))...)))))))))).(((((((((..((.((.(((............)))...)).))...)))))))))(((((((..((((((((((((((.((((.(((((..((((.....(((((.((((.(((....))))))).))))).......(((((((((.(((.((((((.((((((..(((((..(((.......)))..))))))))))).....))).)))))).)))))))))..(((....)))...)))).))))).)))))))))..........((((((.......))))))..))))))))).......))))))).(((((((((.(.(.(((((....((.((((((...((((((((....)))(((((.(((((((((((...................)))))))....((((....(((((((((....((((.((((((...(((....)))...))))))...))))...)))))))))...))))........((((((.............)))))).........))))))))).((((((.((.....)))).)))).))))).................(((((((((......((((((.(((((.((.(((((..(.(((((((.......))))))))))).)).)).)))))..........((((......(((.(((((((((((((((((((....))))))))))..........)))))))))))).......)).))..((((((((..(((((((((((((((.(((((.................))))).))))((((.(((((((...(((((.((((((.(((((...(((((((.((...........)))))))))..............((((((((....))))))))((((((((((((.......................))))))))))))...((.((((((((....((((((((...........(((....))).....(((((.(((((((......))))))).)))))......))))))))...)))(((((................)))))............................))))).)).))))).)))))).)))))...))))))).))))(((((((...))))))).(((((..((((.......((((((..((((..((((((.(..(((.((((((.((((..((((((...........)))))).))))....(((((...((.(((.((.((((..((((...)))))))).))))).))))))).))))))))))))))))))))..)))))).........))))....))))).....)))))))))..))..))))))))...))).))).....)))))).))).))))))))))))).).).))))))))).(((((.....(((((((((...........)))))))))....)))))....))))))..((((..(((((((((((((...(((((...((((.(((((((.(((....)))..)))).))))))))))))...((((.((..((((((((....(((((...))))).)).)))))))).))))((((((.....))))))((((.....)))).))))))))))))))))).......((((((((.....(((((.......)))))...)))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((((..((((((((((((((((,,((((,((({.((((....}}))(((((((((((((((((.((((((.(...((((((((((,{(,(((((((({(((((((..,.((((((((...(((((((.((((.((((((((((((((.((((((((..(((((.((....)).))))).)))....)))))..)))},),}))))))})).)))).))}),)))}....)))))))).(((((((((((((((((.{,{({(((({{((((((....||(((((((.((((((((((((((({.(((,.,,{,,.}||.}|,(({(({((((((((,..((,(((((,(,,(((((.(((((..{((({{{{(((({|.,,(({{.|{(({.|||},...||{{{{((({..(((((.(({{..(((((..(((....))))))))..)).)).))))).,,,||{{{(((({{..((((....{(((..,.,||}}...})))})}))),,.,,(((({{((((..,{{((..(((.....)))..}}.....(((...}}}.......,,..|||.,....{{{{.{|,.......)).))))))|)))))))))).}}})).{(((....)))).}}))))))})}}})))))}.,.}}}}}.))..,...........(((((((((((((,,{........,.}.)))))))))..))))....})))))))))}})},.{{((({.......)})))),))),})))))))))).))))))}((((.(((((..({.(((((((((((......))))))))))).}},..))).)).)))).((((((((((((((((........)))))))).....((((((((.(((((((...,,((({(({,{{((((((((((((((((....{{{((({,.(((((((((.((..(((((....))))).)).)))))).))}...,..|||||.,..,,{{{||.....))))|{{|.,,||||{,.||,.,,,,..,{|||,...{{||{|.....}.}))},},}|}}|}},|,,}}}}}||||||,,....((((.((((......)))).)))).{{.,|||,,..,....,|||.|..(((((.(((....)))...))))}{|.(((((....))))),)),})}},))))))).)))))))).....(((,............,,))).)))))))),{,...(((,((((..(((({...,..,.}}}}}..)))).))),.}}.,.))))))))))))).}}|{,,||||.,.,..((((((,,(((((.{.((((((((.(((((((..(((((..((((((,({{.{{|.,.(((.(((((.{{.....((((.((.....)))))).....,}.))))).)))....{{((.,,,}}||{.,.||,{{||,{||...(((.....))))))))),,),..))))..)))))..)))))))..))))))))..,(((.((((....)))).))){{.{((((((({(((|......(((({....((|({|,{.((((,...{(((........))))||||..|..||||.(((((((((.,.(,..........{((((((((.......))))))))),,.))))))))).)))),),)))))...)))}}.,,,,|}}},....(((.(.......).))).,||||((..((((..,....,.)))).,))..})))})))))))}.},........,,.))))))))))))..,||||},|}||}}|}),,,,))),},..))),,.))))))))))))))))).....((((((((.((((((......)).))))))))))))..,..))))))},||{({.(((....))),})))})))))))))),.))).)))))))..}.)))))).)))))).))))))))))}....(({(((((({.((,....}.))..||},,}}}||}.{{{{.|,|,.}}}}..,{{,.,,,.(((({...((,.((((((({((((((((((((((({({.((((((((((((((.((((.(((((..((((..,..(((((.((((.(((....))))))).)))))..,,...(((((((((.(((.((((((.((((((..(((((..(((.......)))..))))))))))).....)))},))))).)))))))))..||,.,...,,...)))).))))).))))}}))),,..{{{{{((({,.,..}}|||}))),,..)))))))))..,|.({(((((((((..(((((((.((.((.....}},(({{,.....)})})).((((..((.(((((.(((((((((((.......,{,.......,,)))))))....((((....(((((((((....((((.((((((...(({....,}),..))))))...))))...)))))))))...)))}........((((((.{..........,))))))........,))))))))),)})))).)).)))))))..)))).)))))))).})}..|........,.,,,,,.,.,||{,|,,...(((((.{(.(((((..{.(((((((.......)))))))}))).)).)}.)))))...}}))})}.|||}}}...(((.(((((((((((((((((({....}))))))))).,,.....,,)))))))))))),,.....}},.........,(((((...(((((((((,,..,((({{........{{{{...},.....}))|}.....(((({,{(((((.((((({{{({,{{...(((((((.((...........)))))))))......,,,...,.((((((((....))))))))((((((((((((..............,}.......))))))))))))..,}}..))))).)))))))))))...........}}}}}....)))}})))))}))){((((((......))))))}((((((...))))))},,,....,,{{{(({...,............}},}||..{((((((((((((((....{((((,{(((..{({,{{,((({({(((.((({{{.{{{{.{,..,,),))}))))).))))}.,}}}.)))}}}}}))})..}))))})))))))))).)))))..}}))))))))).((((..((((((...........)))))).))))....{((((...((.(((.{(,((((..((((...))))))))},}))).)})))))))))))).}.))...)))))...},},,............,,}}}}))))).,))})))).,))))))))))){((|{|,,{(,(((((((({.(((.((.(((((.(((.((.,((((...(({{{{.|,..{{||.,.)))),.})))))...))))..)).))).))))))).))),{{{.....)))..))))))))}.||,||}|.},.}}}......((((,(((((((((.((((..|{((.{{...)).)))|.((((((....)))))).|,...)))).)))))))})}},))))...)))))....)))))))}....{((.((((.{{((({(((.....))))),))}).)))).))}.,.{{{{((((,..{,((({(.......}}}}}.,,)))),)))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001085454.2 NCBI
AGAAGCGGCCGGGAGCCGCGCAGGGGGCGGAGAGAGGAGCCGCGAGCGG… 3810 nt 0.6294
NM_014030.4 NCBI
AGAAGCGGCCGGGAGCCGCGCAGGGGGCGGAGAGAGGAGCCGCGAGCGG… 3783 nt 0.6305
Summary

Enables gamma-tubulin binding activity. Involved in positive regulation of microtubule nucleation and regulation of cytokinesis. Located in several cellular components, including focal adhesion; microtubule cytoskeleton; and mitochondrion. Implicated in attention deficit hyperactivity disorder. Biomarker of Huntington's disease. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulated the GIT1 in oligodendrocytes, where it was upregulated as part of the regulation of actin cytoskeleton pathway, indicating a role in methamphetamine-induced cytoskeletal alterations in glial cells [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].