Basic Information

Symbol
ALDH1B1
RNA class
mRNA
Alias
Aldehyde Dehydrogenase 1 Family Member B1 ALDHX ALDH5 Aldehyde Dehydrogenase X, Mitochondrial Aldehyde Dehydrogenase 5 EC 1.2.1.3 Aldehyde Dehydrogenase 1 Family, Member B1 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Aldehyde Dehydrogenase Family 1 Member B1 Acetaldehyde Dehydrogenase 5 ALDH Class 2 EC 1.2.1
Location (GRCh38)
9:38392623-38398661
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Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000692.5
Sequence length
3028.0 nt
GC content
0.5178

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1094.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1148.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 597.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000692.5 NCBI
GGAGGCGGGACCUGCGGCCAGCCCUGGGCGGCCAUGUGGACAGAGCUGG… 3028 nt 0.5178
Summary

This protein belongs to the aldehyde dehydrogenases family of proteins. Aldehyde dehydrogenase is the second enzyme of the major oxidative pathway of alcohol metabolism. This gene does not contain introns in the coding sequence. The variation of this locus may affect the development of alcohol-related problems. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in the Oncopig (Sus scrofa) model of alcohol-induced liver fibrosis demonstrated that the ALDH1B1 was upregulated in fibrotic livers compared to controls, where its increased expression contributes to ethanol oxidation and reactive oxygen species overproduction [Yasmin et al. DOI:10.1016/J.Biochi.2020.12.022].