Basic Information

Symbol
GLCCI1
RNA class
mRNA
Alias
Glucocorticoid Induced 1 FAM117C GIG18 TSSN1 Glucocorticoid-Induced Transcript 1 Protein Glucocorticoid Induced Transcript 1 GCTR
Location (GRCh38)
7:7968796-8094272
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138426.4
Sequence length
4741.0 nt
GC content
0.4716

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1545.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1627.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1444.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_138426.4 NCBI
AGUUGCCAUUCGGAGUGAGGAGUGGGUAGAAGCGGCGGCGGCGGCGGCG… 4741 nt 0.4716
Summary

This gene encodes a protein of unknown function. Expression of this gene is induced by glucocorticoids and may be an early marker for glucocorticoid-induced apoptosis. Single nucleotide polymorphisms in this gene are associated with a decreased response to inhaled glucocorticoids in asthmatic patients. [provided by RefSeq, Feb 2012]

Forensic Context

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