Basic Information

Symbol
ALDH1L1
RNA class
mRNA
Alias
Aldehyde Dehydrogenase 1 Family Member L1 FDH Cytosolic 10-Formyltetrahydrofolate Dehydrogenase 10-FTHF FTHFD 10-FTHFDH Aldehyde Dehydrogenase 1 Family, Member L1 Aldehyde Dehydrogenase Family 1 Member L1 10-Formyltetrahydrofolate Dehydrogenase Formyltetrahydrofolate Dehydrogenase MER57B-ALDH1L1 EC 1.5.1.6
Location (GRCh38)
3:126103561-126197994
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012190.4
Sequence length
3064.0 nt
GC content
0.5757

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1215.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1271.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 940.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001270364.2 NCBI
UCUGCGGCACCAGGACUGAGUAGAAGGGAGAGAGUGGAGAAGGGGAAUU… 3178 nt 0.5752
NM_001270365.2 NCBI
ACAGGUCCCACCUCCUGGCUCCCAGGACGGGUCUGCACCAACCUCAGUU… 2761 nt 0.5744
NM_012190.4 NCBI
ACAGGUCCCACCUCCUGGCUCCCAGGACGGGUCUGCACCAACCUCAGUU… 3064 nt 0.5757
Summary

The protein encoded by this gene catalyzes the conversion of 10-formyltetrahydrofolate, nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADP+), and water to tetrahydrofolate, NADPH, and carbon dioxide. The encoded protein belongs to the aldehyde dehydrogenase family. Loss of function or expression of this gene is associated with decreased apoptosis, increased cell motility, and cancer progression. There is an antisense transcript that overlaps on the opposite strand with this gene locus. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2012]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ALDH1L1 is a marker equivalent to GFAP for labeling and characterizing reactive astrocytes [Cieri et al. DOI:10.1111/jnc.15941].