Basic Information

Symbol
GLI3
RNA class
mRNA
Alias
GLI Family Zinc Finger 3 PAP-A PAPA1 PPDIV PAPA PAPB ACLS Glioma-Associated Oncogene Family Zinc Finger 3 GLI-Kruppel Family Member GLI3 Transcriptional Activator GLI3 Zinc Finger Protein GLI3 Oncogene GLI3 GLI3-190 GLI3FL GCPS PHS Greig Cephalopolysyndactyly Syndrome GLI3 Full-Length Protein GLI3 Form Of 190 KDa DNA-Binding Protein
Location (GRCh38)
7:41960949-42264265
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000168.6
Sequence length
8405.0 nt
GC content
0.5146

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2729.87 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2880.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2029.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000168.6 NCBI
ACACUCGCACUCGCGCACACCCGCCGCUCCCACUCACCCGCGCCGCUCU… 8405 nt 0.5146
Summary

This gene encodes a protein which belongs to the C2H2-type zinc finger proteins subclass of the Gli family. They are characterized as DNA-binding transcription factors and are mediators of Sonic hedgehog (Shh) signaling. The protein encoded by this gene localizes in the cytoplasm and activates patched Drosophila homolog (PTCH) gene expression. It is also thought to play a role during embryogenesis. Mutations in this gene have been associated with several diseases, including Greig cephalopolysyndactyly syndrome, Pallister-Hall syndrome, preaxial polydactyly type IV, and postaxial polydactyly types A1 and B. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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