Basic Information

Symbol
GLRA3
RNA class
mRNA
Alias
Glycine Receptor Alpha 3 Glycine Receptor Subunit Alpha-3 Glycine Receptor, Alpha-3 Polypeptide Ligand Gated Ion Channel
Location (GRCh38)
4:174636920-174829247
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006529.4
Sequence length
8697.0 nt
GC content
0.3392

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1985.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2164.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1833.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001042543.3 NCBI
AACCCAAGGUGGAGAGCUGGAUUCCGGCGGGCGGCGCUUGGAGCAGGUG… 8652 nt 0.3389
NM_006529.4 NCBI
AACCCAAGGUGGAGAGCUGGAUUCCGGCGGGCGGCGCUUGGAGCAGGUG… 8697 nt 0.3392
Summary

This gene encodes a member of the ligand-gated ion channel protein family. The encoded protein is a member of the glycine receptor subfamily. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Nov 2013]

Forensic Context

A study in mice selectively bred for high or low methamphetamine intake identified the GLRA3 as a prefrontal cortex differential wiring gene, indicating its transcriptomic network connectivity differs between lines with divergent addiction risk [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].