Basic Information

Symbol
GLRB
RNA class
mRNA
Alias
Glycine Receptor Beta Glycine Receptor 58 KDa Subunit Glycine Receptor Subunit Beta Glycine Receptor, Beta Subunit HKPX2
Location (GRCh38)
4:157076100-157172090
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000824.5
Sequence length
3033.0 nt
GC content
0.3716

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-778.44 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -836.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 851.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000824.5 NCBI
AGGCGCGUCAGCCGAGCUCGGCGGUGGCGCGGGCGGCUGGGACGCAGCU… 3033 nt 0.3716
NM_001166060.2 NCBI
GGGGCGGCGGAGCGCGAGGAGCACUGCGGCGUGCCCGGGAGGACGCGCG… 3041 nt 0.3749
NM_001166061.2 NCBI
AGGCGCGUCAGCCGAGCUCGGCGGUGGCGCGGGCGGCUGGGACGCAGCU… 2740 nt 0.3609
Summary

This gene encodes the beta subunit of the glycine receptor, which is a pentamer composed of alpha and beta subunits. The receptor functions as a neurotransmitter-gated ion channel, which produces hyperpolarization via increased chloride conductance due to the binding of glycine to the receptor. Mutations in this gene cause startle disease, also known as hereditary hyperekplexia or congenital stiff-person syndrome, a disease characterized by muscular rigidity. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2009]

Forensic Context

A study in mice selectively bred for high or low methamphetamine consumption identified the GLRB as a differentially wired gene in the prefrontal cortex, indicating its altered network connectivity is associated with innate genetic risk for addiction-related behavior in the absence of drug exposure [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].