Basic Information

Symbol
GLS2
RNA class
mRNA
Alias
Glutaminase 2 GLS GA HLGA LGA Glutaminase Liver Isoform, Mitochondrial Glutaminase 2 (Liver, Mitochondrial) L-Glutamine Amidohydrolase EC 3.5.1.2 Phosphate-Activated Glutaminase Phosphate-Dependent Glutaminase Breast Cell Glutaminase Glutaminase I L-Glutaminase
Location (GRCh38)
12:56470945-56488414
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_013267.4
Sequence length
2387.0 nt
GC content
0.5279

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-868.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -906.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 775.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001280796.2 NCBI
AGAGGUCCCGGGCGCACCUGCAGAGCCGGAGGCUUGCUGGGGCAUGCGC… 2460 nt 0.5256
NM_001280797.2 NCBI
AGAGGUCCCGGGCGCACCUGCAGAGCCGGAGGCUUGCUGGGGCAUGCGC… 2257 nt 0.5299
NM_001280798.2 NCBI
AGAGGUCCCGGGCGCACCUGCAGAGCCGGAGGCUUGCUGGGGCAUGCGC… 2035 nt 0.5302
NM_013267.4 NCBI
AGAGGUCCCGGGCGCACCUGCAGAGCCGGAGGCUUGCUGGGGCAUGCGC… 2387 nt 0.5279
Summary

The protein encoded by this gene is a mitochondrial phosphate-activated glutaminase that catalyzes the hydrolysis of glutamine to stoichiometric amounts of glutamate and ammonia. Originally thought to be liver-specific, this protein has been found in other tissues as well. Alternative splicing results in multiple transcript variants that encode different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2013]

Forensic Context

A study in human postmortem brain tissue from individuals with alcohol use disorder (AUD) demonstrated that the GLS2 was downregulated in the amygdala of AUD subjects in a second validation sample set [Lim et al. DOI:10.1038/s41398-021-01635-w].