Basic Information

Symbol
ALDH1L2
RNA class
mRNA
Alias
Aldehyde Dehydrogenase 1 Family Member L2 MtFDH Mitochondrial 10-Formyltetrahydrofolate Dehydrogenase Mitochondrial 10-FTHFDH EC 1.5.1.6 FLJ38508 Aldehyde Dehydrogenase Family 1 Member L2, Mitochondrial Probable 10-Formyltetrahydrofolate Dehydrogenase ALDH1L2 10-Formyltetrahydrofolate Dehydrogenase ALDH1L2 Aldehyde Dehydrogenase 1 Family, Member L2 Aldehyde Dehydrogenase Family 1 Member L2
Location (GRCh38)
12:105019784-105107643
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001034173.4
Sequence length
7428.0 nt
GC content
0.4149

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2064.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2205.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2048.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.(((((((.((.(((....))).)).))))).)).((((((....)))))).......((((((((((((((((.........))))))(((((((....(((((((((..((.(((((.....))))).))...((((......))))((((..((((..((((((.(((.....(((((........))))).....)))))))))))))))))....(((((.((((((...(((((((((((((((((.....))))((((........)))).........(((((....))).))..(((((((((....(((((....((((.........))))..)))))...)))))))))((((.((((((.((.......))..)))))).))))....((((.(((..(((((((.((((((((.(((((.((((.((((((...)))))))))).)))..........)).))))))))..))))))).)))))))))))))))))))).)))))).)))))......(((.((((((((((........(((.((((....)))).)))....(((((((((.....)))))))))...(((((((..((..(((((((....((..(((......(((((((.(((((.((((...........))))....)))))((((.((((((.............))).))).))))(((((..(((((((..((((......))))........)).)).)))...))))).)))))))...)))..))...)))))))....)).....))))))))))))))))))))...)))))).)))((((((....)))..))).......)))))))..))))))))))(((((((((((((.(((....))))))))))))))))((((((((((.....(((((.((((.((((((..((((((((((...((((((((...(((((((.(((((((.....))))..((((((......)))))).((.((((((((...(((((((((((((.....)))).)))).(((((........((((((((((((...(((((((.((....))..)))))))...)))............)))))))))...(((((((((((((....((((((...((((((((........(((((((((........(((.((((..((....))..)))).)))((....))....(((((((.(((.((((((.(((((.(((((..((((((..((((((((.(((((....)))))..(((((((..(((((.........)))))..))))))).......((((((((((.(((....(((((..............)))))......((((((((.(((.(((..(.(((((((((((((((((..(((((....)))))..)))).))))(((.((((.....)))).))).....(((((..(((..(((.((.......((......((..(((((..((((((((((((((..((.((((.......)).)).))..)).)))).......((((((((...))))))))))))))))...(((((((((..((..((.(((((((((((..........))))))))))).))..))...........))))))))).........)))))..)).......)).......)).)))..))))))))........(((....))).(((((((((.(((((((...(((......)))..))))))).)))))))))....((((((.......))))))(((...((((..(((((......)))))))))...)))...)).))))))).)..))).))).))))))))...(((((..(((((((((.((((((((((..((((((((((((((((.((((((((....((..((((((.((...(((((((...(((......)))..)))..)))).....((....)))).))))))..))....))))))))......(((((.....)))))...)))))))))))((.(((((.((((.((((........)))).)).))))))).))...((((((......))))))..(((((.((((((......)))))).)))))..(((((((..((((((..(((((((........)))))))..)).))))......)))))))..............)))))...)))))))))).)))....((((....))))(((((((............))))))).))))))..))))))))...))))).)))))..((((((...(((((((((((((.(.((.(.((((((..((((((((((((((.......(((((......))))).....(.((((((....)))))).).((((......))))(((((((.(((((.((((((.((....(((.((((((..(((....)))...)))))).((((.....)))).)))....)).))))))..))))).))))))).......(((((....(((......)))...(((((((((....(((((.((((((((((......))))..............(((((((((((((((((((((.(((....((((((((((((.((...(((....(((((((((((((((.....((((.(((..(((.....))).....))).)))))))))).......(((((((((..(((((((((((..((((.........(((((.....((((((((...(((.((((((.(((((((((.(.((((...................((((((((((((((.((((.((((((((((((((...)))).))))).))))).(((((....)))))...((((((....)))))).....((((.......)))).((((...))))((((((...)))))).............))))...((((....))))))))))))..))))))(((((((((..(((((.((..((......)).)).))))).....((((((((((.(((((...))))))))))))))).(((((.......(((((.((((((..((((((((((.....))))))).......((((......))))..((((((((((((((...........((((((.......)))))).......))))))).))))))).)))..)))))).))))).(((((.....)))))...........((((((((.((((((((((...))))).......((((((((((......(((((((((...((((.(((.......)))))))..)))))))))........((((...))))...(((((((((((....((((((.((((.(...((((........))))..((((((............))))))................).))))))))))....))))))))))).(((.((.....)).)))))))))))))(((....))).........((((....))))(((((((((...........)))))))))..))))).)))))))).....((((((((((.............((((((......))))))(((((.....)))))(((((.........................))))).((((((..(((.(((((((((...((((((((.((((..((((((.(((((((...........((((......(((((((((....((((((((((((((.....))))))))))(((.....))).(((((....)))))....))))..))))))))).......)))).))))))))))..)))..))))..(((((((.(((((.........)))))....)))))))((((...((........))...)))).....(((((((.(.(((.((...)).))).).))))))).....(..(((((.(((...))))))))..)......((......(((((((...((......)).)))))))......)).(((.......))).((((((......))))))......((((((.((((((........))))))..))))))(((((((((((((((((...((..(((((......)))))..))...............................((((((..((((((...))))))..))))))...))))).))))))))))))..)))))))).))))))))).))).))))))...................))))))))))))))).)))))))))............(((((((((..(((.....((((..(((((.((((((((..(((((((..............(((((((..((((.(((((((((((((.((((((((.........)))))..(((((((((....(((..((((((((....)))).))))..(((((((((.....................)))))))))((((((((........(((((((((((........))))))...)))))..............((((.(((..((((..........))))..))).)))).....))))))))...)))...)))))))))(((((.((.((((((...))))))))))))).))).))))))..)))))...)).))))))))))).((((.....))))...)))))))...)).)))))).((((......)))).)))))....))))......)))....)))))))))(((((((.(((..((((..........((((((.((........))..))))))......((((...(((((...............)))))...))))......(((((((((........((((((((.((((..((((....((........))...))))..)))).)))))))).......)))))))))............((....))...(((((((((.(((((((((.......))..)))))))..)))))))))...........((((.((((((.(((((.(((......))))))))...)))))).))))))))....)))))))))).....)))).)))))))))).)))))))))....(((...)))..(((.....))).((((((((.......((((........))))........))))))))...(..(((.......)))..).))))))))(((....)))...............)))))...))))..))))))).((((((....................)))))).)))).))))).)))).((.((...)))).((((((((.......((((((....((((.......))))..)))))).......)))))))))))))))))...)))...)).)))))).((..(((((.((((......)))).)))))..))..((((..(((((((..((((((((((((.((.......))))))))))....))))..))))))).)))).)))))).....))).)))(((((......)))))...((((((((......)))))))).........)))))))))..)))))))))(((((((..((((..........))))...((((...((..(((((.....(((((......)))))....)))))))...))))...))))))).))).))).))))).....))))))))).)))))....)))))))).))))))....)))))).).)).)...)))))).(((((.(((((((((......)))).))))))))))..........)))))))..))))))((((.(((..................))).))))))))).)))..))))))))))))))..)).)))))).))).))).))))))))))))))))))))).......(((((((.........(((.......)))........))))))).))))))....))))))(((((((((((...(((..((((((.......((((((.((((....))))(((((......)))))))))))((.(((((((.((....)).))))))).))........((((.......)))).....))))))..)))...........))))))))))).(((((.............)))))))))))).)))))...)))))))))))))..))...((((((((((.((...(((((((.((.(((((((((..........(((((((.(((.........))).)))))))...((((.((((...(((((((......(((.(((((..(((((((((((.........((((((................((((((((............)))))))).((((((.(.(((((.........((((((((..(((((.(((.(((((...(((.....(((.(((((((((..((((......))))..))).....)))))).)))......)))))))).))).)))))))))))))...((((((.((...((((...........))))..)).))))))........))))).).))))))..............)))))).......((((..((((......)))).))))..))))).))))))..)))))......(((((...)))))........(((....(((.((((.((((((((....)))))))))))).)))..))).(((((.(((..((....))..)))...)))))))).....))).....)))).)))).))))....))))))...))).)).)))))))..))))))))))))...))))).)))))......))))))))............((((((....))))))...((((((((((((...............((.((..((((((.....))))))..)).))..........(((((((((........)))))))))....))))))))))))(((((((((......)))))))))..(((((...)))))......)))))....)))))..(((.((((((.........)))))).))).......)))))).....)))).))))))))))))))).................))))).(((((................)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((.{,((((({(,{(,({,..,))})).)))),})).{(((((....)))))}.......(((((((((({(((((.........)))))|(((((((....(((((((((,,((.(((((.....))))}.||,,.((((......))))({{,,,{{{{..{(((((.{{,..{,,(((((........))))}..},))))))))))))))))))}}..(((((.((((((...(((((((((((((((((.....))))((((........)))).........(((((....))).))..(((((((((....(((((....((((.........))))..)))))...)))))))))((((.((((((.((.......))..)))))).))))...,(((,{(((..(((((((.((((((((.((({{,(({(,{{((({.,,||}}}}}}}),))},,,,,.,,}.)),))))))))..))))))).)))))))))))))))))))).)))))).)))))}}}}}.(((.((((((((((..{....,(,,.{{((,,,,|}||,|||,...{(((((((({,,..|}}}}}}))..{(({{{((,{({{(((,((((..,,,...,||.}}}}..||||{{|{{{{|,||{{.,|,.,,,),,)))),...,)))))}|},|||||,.....||,...,.|||,|,},}))}{{((({,{((((((,.,{{({,......|||,.{{{,{|}{|..||}...)}}}).,))})))}}})))..,}...))),)))}}}})).,}.,)}})))})))))))))))))...)))))).)))((((((....)))..))).......))))))),.))))))))))(((((((((((((.(((....})))))))))))))))((((((((((.....(((((.((((.((((((..{{,{((((((,{,((((((((...((((({{.{,{,,,,.,{{{,|{{..((((((......))))))....(((((((.(((((.((((((((((.....)))}.{((((((.(((.......(((((((((.....(((((,(.,{{..{(({.,|....}}.})))},}....}))}}})))))))))((((((((((((.(((.((((.(((....((((((((........(((((((((.{{,,,,.{{{.((((..({....})..)))).}}}.....,)),}..({(((((.(((.((((((.({((,{(((((..{(((((..((((((({.........({{((((({((((({.,(((((.....,,,,)}|||.,|||||||...{(({(,{{{||,,,,||{||,,({{((...,..........}||||....,.,,,{{|((.(((.{,,..,.{{{{|{||{{{{(((({..{{|{{....)))))..}})}.)))){{{,{|{,...,.)))),|||....,(((((,{((({.(((.{(,.{,{{.(({,.,,,((,.(((((,,({{{((((((((((,,((.((((,,,,,..|||,|,,|,{||..,,,...,,{.,(((({((,..|||||||||||}}}}}...,((((((((..{,..{{.,{(((((((((,,....,,..))))))))}}|.}}|,,,.,)}.......))))))))|{{{{{{{{{,,,}|,,||..{{{{{||{,..{{{||.,}},.||||||||.,,...,,{,,.||.}}},(((((((((.(((((((...{((......)))..))))))).)))))))))....((((((.......)))))}(((...((((..(((((......)))))))))...)))..,||{|}|||||,{,{|||{}}},|,}}}}))...,||||}}|||{{{||||{|||||{{,,..{{,..(((((((((((,(({{({(({(,{{,..,{{{{{.{|...,||||||.|.|||......})),,||,..}))}{,,.,{{...,}||,.||||,}{..,..,,}})))}))},},},(((((.....))))).,,)))))))))))||.(((((.{{((.((((........)))).)).))))))).}}}))},{|||}}.}}})),}||.{(((((,((((((......}))))),)}}))}}||||.}}}})))}|||.{((((((.,....,.))))))),,,..,,}}.....)))))))))}............}}},....,|||}},})),}}}}}}}|,||}.}}))))|,||||{.,},........))))),)}))),,,.{||||||||{{{||||||,,}||{.(({{{(,,,({(((({{{{(((.,.{(,{{({{{{{..,{{{{{{{(({{{((((({.....}))))}..}}||,|||,|{.{(((((....)))))).,.((((......)))).,{{{|||{{|((,(({,((|||..,.||..||||||..{{{,,..)}}...})))))}||||}}}.,)),|,|||..,,|}{|}||||{{|||||,|||||||,,,....{{{{{,,,..{,...,,.|||,{{(({((({{,...,((((({((,..|||||}}},....}}},}}},...,,.|,{((((((({{(((({{{{{((,{{{,...{{{{{{{((({{,((...,{{,,,.((((((({.(((((({....,{{{,{{,..(((.....))).....,}}.}}}))))))).......{((((((((..(((((((((((..((((..{,,....((,(((((((((((.....))))))))))},||{{{((.((.(((((((({,...............((((((((((((((,((((.(((((((((((((,...,))).))))).))))).(((((....)))))...{(((((....)))))|..,..{{{,,,,{,.,{{{,.{,,...,)})}{{{{{{...))))))..,,.,,,.....)}}}...((({....))))))))))))..))))))||....,,,,,(((((.((..((......)).)).))))).....{((((((({{{(((((...))))))))))))))|((((({.........|})))){{(({{{,..{(((((((((({,.{((((...((((((({((((((((...((((((((((((((...,.....,.((((((.......)))))).......))))))).)))))))......,.{{{{,.,,,..|||||..,,,|||||,...,......}}},((((((...)))))))))))..}})))..))))))})))).))))))))))))}}}}}},}}.))))))))}))}....,.....{(((((((((....(((({{{{|||{{.{((((((((((....((((({,((((.{...{(((........)))}..{(((((............)))))}................}.))))))))))....})))))))))).|(({(,,{{....,}|||||}.,}}|,{({....}||,{,,..{,{((((....)))}(((((((((...........)))))))))..,||||,{|,,,....,,,.{(((((({{{.....,,,.....((((({......))))))(((((.....))))){{||,...,,,|{{{{{{{{,{{.......,,|||...,...,|||{.{...(((((...((((((((,((((..((((((.(((((((.{,,,......{,,,......(((((((((.{,.((((((((((((((.....))))))))))(((.....))),(((((....)))))....)))),,))))))))).......}))).)))))))))}..)))..)))).,|.{{{{{.|{{({{,..,,,|.}}||||||,||}||||{||{.,.||........}}...}}}..,,,,{{{{{||,|,|||.||,,.}}.}}|||,||}}}}}.....({.(((((.(({...})))))))}},,,,,}.,),)))},|{{{|||..,||,,,....),)))}}}}....{(({.{((....}}.))),((((((......))))))......((((((.((((((........))))))..)))))){((((((((((((((({...{{,.{{{{..,,.,,}}}}}..,,.,},.....................,{{{,.{{{{((..((((((...))))))..)))))),..})))).)))))))))))},,})))}}}}.}})))))),}))).))))},...................,}}}}})))},,({({...,||||...{{||||....(((((((((,.(((.....((((..(((({.((((((((..(((((((..............(((((((..{(((.{{(((((((((({.((((((((.........)))))..(((((((((....(((..,{{,{{{{..{{|||}.}})),.{((((((((.......,,,.....,,}...))))))))}{((((((({,,.....{((((((((((........))))))...))))).,,||,....,,,.((((.(((..((((..........))))..))).)))),}}..}))))}}}...)))...)))))))))(((((.((.((((((...))))))))))))).))).}))))),.,))))...)).)}},))))))).((((.....))))...)))))))...))})))))).((((....,,))}}.}))))....))))......))).,,,}})))))))(((((({{({(..((((...,,{,,,.{((({{.{{,,,,....||,.||||,,......,,,{...{((({....,,,,,.|||||}},||,|,}}}},,,...(((((((((..,,....((((((((.((({..((((....((........)}...))))..}))).))))))))...,...)))))))))............{{,,..))...(((((((((.(((((({((.......))..}))))))..)))))))))...........((((.((((((.(((((.(((......))))))))...)))))).))))))))....}}))))))))..,.{||}}}},,,.,.)}}.......,|,,,,,||,.,,})),.{((..,..))).,|||||,|,}},},.||||.,,,,..,))))}}}}}...))),,}},.......)))))))))).},})}}}|{,.....}},...,.................,}})},.))))..))))))}.,,,{{,......,||........,,||}}}},|}))).))))).)))),,{.{{..{||||((((((({,,{{{,,.,,||||,,..,{{{...,,,,,|||,,|||,||||,,...}}}|}||||,,}}}},,...}},...},.)))))}..,..,||||.||||,,,,..)))).|||||...}}}||{(..(((((((..((((((((((((.((.......))))))))))....))))..))))))).)})),))))))},})}})}})))|{{{{.,,,,.))))}...((((((((......))))))))}|},.,..,)))}))))}..)}))))})}|||||||,.||||,,,...,},,)))),..||||.}.||,.|||{|,,...(((((......)))))....}))),,}.,.)),)...}))))))}))}.})),})))).....))))))}))}))))},...,))))))).)),))),.,,)))))).)},)}}}}}))}}}}.(((((.(((((((((......)))).))))))))))...,,,,.,.})))))),.})}}}}{||(|{|,..}}}....,........)))})),))))))},))..))))))))))))))..)).)))))).))).)))))}))))))))))))))))))).....))).}}})).))).)))))....),}))))).))).))).)))}..,)))))))),.}))..))))))).(((.(((((((((((....,,,,....,||},((((....))))(((((......))))){{{{({,{.{{{{(((.(({{{,,|.|||||},.,|,,,,,...((((.......))})........||(({{.{{({{{..,,,)))))})}}}}|}|||.|},.,.....,,,,))||,.....}}))))))))))).))).})),,))}),...,(((((((((.((...(((((({.((,{((((((((.,,,,,,,,{(((((((.(((.........))).)))))))...{{{{.((((...(((({,,.....,|{{.(((((..(((((((((((,{{{,{...((({{(...,,,..........((((((((............)))))))).,{((((,({(((({.........((({(({{,.{{(({.(({.{{{{{...{{{.....(((.(((((({,{,.((((......}}}}..}}},,|,,)))))),}}}......}}}}}})}.}}).}))))}}|||||,...|||||{,||...,,|{.,.,,,,....)))),,)),)))))}....,},,)}))).,,))}))}...,{{{|......}})))),......{(({..((((......)))).}))).,))))).))))))..))))}....,.{{|||,..,}}},.......,{{{....(((.((((.((((((({....)))))))))))).))}{,|},.(((((.(((,.({....}).,)))...)))))}},))}...,......,}}),)))}.))))....)))))),.,})),)}.}))))))..)))))))))))),,,)))}}.)))))......)))))))}...,,,,,,,..,,{{{|...,)))))}...((((((((((((...............((.((..((((({.....))))))..)}.))..........(((((((((........)))))))))....))))))))))))(((((((((......)))))))))..(((({...))))).,,.,,})}}}...,)))))}||{,.((((((.........)))))).}}....,,..)))))).....)))).))))))))))))))).................))))}.{((((..,..........,..)))),

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001034173.4 NCBI
AGUGCUAGCGCUCCUCUCCAGCAUGCUGCGGCGGGGCAGCCAGGCGCUC… 7428 nt 0.4149
Summary

This gene encodes a member of both the aldehyde dehydrogenase superfamily and the formyl transferase superfamily. This member is the mitochondrial form of 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase (FDH), which converts 10-formyltetrahydrofolate to tetrahydrofolate and CO2 in an NADP(+)-dependent reaction, and plays an essential role in the distribution of one-carbon groups between the cytosolic and mitochondrial compartments of the cell. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene.[provided by RefSeq, Oct 2010]

Forensic Context

A study in mice and rats demonstrated that the ALDH1L2 was identified as a downregulated same-trend differentially expressed gene in the corpus cavernosum of animals with age-related erectile dysfunction, where multi-omics analyses revealed conserved molecular mechanisms involving downregulated mitochondrial activity and extracellular matrix alterations [Long et al. DOI:10.1093/sexmed/qfaf078].