Basic Information

Symbol
GLUD1
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Dehydrogenase 1 HGDH1 GDH1 GLUD GDH Glutamate Dehydrogenase 1, Mitochondrial EC 1.4.1.3 Epididymis Tissue Sperm Binding Protein Li 18mP Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Glutamate Dehydrogenase (NAD(P)+) EC 1.4.1 GDH 1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_005271.5
Sequence length
3300.0 nt
GC content
0.4491

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1006.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1070.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 823.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((......)))))).(((.....(((((((((((((((.........((.((((.....(((((.((.(((.(((....))).))).))))))).....(((.((((((((((((((((......)))))))(((.(((((((.(((..(((((.((((((((((.(..((((((.((((((((((((((.(((.((((((.(.(((....)))))))))).........))).)))))))))((.((....)).)).(((((.(((....))).))).)).)))))))))))..).)))).)))))).)))))..))...).))))))).).))...)).))))))).))))))).))....)))))).)))))))))((((((((((((..((((((.(((((((....(((((((.((((..(((((.((.(((((.((.......)).)).))).)).....))))).....)))).)))))))((..((...))..)).(((.((.(((....))).)).)))((((..((((....((((.(((((..........)))))))))....))))..))))))))).))))))))..))))...))))))))....(((((((((...(((((((((.((.((...(((((.....)))))...)).))....(((((..(((((((..(((((......((((((.....))))))(((((....)))))(((((.......)))))......(((((((..(((((((((((((((((.....((((((...(((((((((.((......)).))).....))))))...)))))).....)))))).......).))))).)))))..)).))))).)))))))))))).))))).)))))))))....((((....))))((((.......))))..........)))))))))(((((((.((((((.....((((.(((((((((((((.((((((((((((((((.((((..(((((((((((.....)))).)))))))...((((((((((((.....((((.(((...((((((((((..(....((((((..(.((.((((....))))..)).)....)))))))..)))))).)))).....(((((((((((.((((((.((...(((((((.(((((((..(.(((((...........))))).)..))))))).))...))))).))...(((((((..(((.((.....)))))..(((((.....((((((....(((((((((((....))..))).))))))..........(((((.(((..(((((((((((((((..((((((((((((.((((....(((((.((((..(((((...........(((((((((((((((((..((((((....)).))))..((((((((....((((..((....))..))))..)).))))))..............((((((((...((.(((.((.(((((((......((..(((......)))..)))))))))..)).))))).))))))))..(((.(..((((((..(((..((((((((((.(((((....((((((...((....))..))))))))))).)..........)))).))).))..)))..)))))).).))).((.(((((..........))))))).((((((...)))))))))))).))))))))))).............)))))(((((((((((.((.(......))).))).))))))))..))))........((((((((.((((((.........(((((..................)))))))))))........)))))))).(((((.(((.(((((((..((.(((........((((((((((...(((((...(((((((.....)))))))(((((((............((((..........))))..(((((.(((((((.((((((((((((.(((...........))).)))))))....))))))))))))...))))).........(((.(((..((((((.((((((((((...(((((...........))))).))))))).((((((...))))))(((.((......((((((.........(((((((..(((((...............(((((((..............))))))).......((((....(((((((........)))))))...)))).)))))..))))))).........))))))..)).)))...))).))))))..))).)))....((((((((((..................))))))))))...................((((((((..........((((((((.(((............)))))))))))))))))))..........))))))))))))...))))))))))......)))))..))))))).))).)))))...........))))).)))).)))))))))).....((((((((..(.(((......))).)....))))))))........))...)))))))))))).)))...)))...)))))....(((....(((((((((((.....)))))))))))..)))..)))))).....)))))))))))).......))))))))).))))))))....))).))))..)))))))))))).((((((((((.((((.....(((.....)))...))))))).))))))).((((((..........)).)))).)))).)))).))).........((((.(((((....................))))).)))).....(((....))).........((((((((((.(((......))).))....)))))))).....)))))))))..)))((((....))))..(((((((((((((((.((.((.(((((((((.......(((......)))(((((((((.....(((((((((((((.(....)))))).))))))))..))))....)))))((((.(((.(((......))).((((................))))))))))).........))))))))).)))).)))).)))).))))))).)))))))))))))).....)))))).)))))))..((((((((.........)))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((......)))))).(((.....(((((((((((((((..,..((.(((..((((({..(((((.{(.(((.(({....})).))).)}))))}..|..(((((((((((((.(((((((,((.(((((.(((((....))))))))))..))}..)).))))).)))))))))))))),.(((((((((.(((.(((((({(.(((....)))))))))).........))).))))))))).|.(((((({((.{.(((({.(,(({...))).)}))).)),,.))))},.})))))|((((((.{{,|....)),..)))))))|.||.{{...)).})}))))).)))..))...,..)))))),,))))))))((((((((((((..(((((({(((((({..,.{((((((.({{{..((((({({.,,{((,(({..,..{||,||{|||.||,....},,))...,,)))).)))}}})||,.,|..})}..)),{{{.,{,|||,,..}}}.}}.)))|||{,.((({.{{.((((.(((((.{,....}}.))))))))).,.,)})},.,)))))))).))))))))..))))...))))))))....(((((((((...(((((((((.{{.{{...{{{{{.....}))))...}).))....(((((..((((((((.,{{,{......((((((.....))))))(((((....)))))(((((......,))))),,,...((((((((((((((((((((((((((.....((((((...(((((((((.((......)).))).....))))))...)))))).....)))))).......}.})))).)))}},})))))))),)))})))))))).))))).)))))))))....{(({....}}}}(({{{......))))..,....,,.))))))))){{{(({({((((((,..,.((((.(((((((((((((.((((((((((((((((.((((.,(((((((((((,...,)))).)))))))..,((((((((((((,{,,.{(((.(({...((((((((((,{(....((((((..{,{,.({((....}))}..}}.}....)))))))},}))))).)))).....(((((((((((.((((((.((...(((((((.(((((((..(.(((((...........))))).)..))))))).))...))))).))...(((((((..(({,({.....}})))..{((((.....((((((....((((((((({(....}}..))),}))))).....,,...(((((.(((..(((((((((((((((..,{((((((((((.(((({{{.{{{((,((((,{({,{,.,,,...{{{{((((((((((((((((({{(((({,....,|||{||{{((((,,{,.,,,{{{(,,({..,.|}..}})),}}},,|}},..,......||||.,{|||||||,..{,.{{|||{,((((({(..,,,.((..(((......)))..))|||||||,.||,,,,,,.,,))))))}}}}|,{{{(((((.{,,(...,,,|,||,,|}|||||}...{{{{{{.,.{{||||||,.}}}}},}|}}|,...,,.,}},,},.|{|||.}}..|||..||||,,{{{{{...,.|}}}},.)}}}})}.,}.))))}((((((...)))))),}}})}.)))))))))}}........,,..,}}}},(((((((((((.((.{......})).)))}}}))))))......||||},,,|}})}((({((((((........,((({{.,,,|,.......}}},.}}}}},}}}}}...,,,.,))))),,,.,,{{|}|||}|||||{|}}|{.,,.,|}|}}.,||||,,(({{...,,,.}}}},{({{{{.{{{,.,,}))},,||||,.,,,,,..,{{,(((({{{.......|||,..(((((.(((((((.((((((((((((.(((...........))).)))))))....))))))))))))...)))))..|||.,,,{,,.(((..((((((.((((((((((...{((((...........))))).))))))).((((((...))))))(((.{(,,....((((((.......{,(((((((..(((((..,.......,,...(((((((..............))))))).,,.||,{,{|||,.{((((((........)))))}},,.,,,}.)))))..))))))).},......))))))..)}.)))...))).))))))..))).}}|{|..((((((((({.{{..{.........,,.}))))))))).,,,......,,,..,,,,|{((((({..........((((((({,(((............)))))))))))})))))))......{{{........)))))))))),)))),,),,,,,||||||..|||,,,,.,,,.,)))}.}}},,}})}.,,))),}))).)))))))))).....((((((((...,{(({{....))}})....))))))))........,,...)))))))))))).)))...)))...)))))..,}(((....(((((((((((.....)))))))))))..)))..)))))).....)))))))))))).......))))))))).))))))))....))).))))}|}}))))))))))}((((((({({.((({,,{{.{{{,...,))).,.))))))).))))))).((({{{.,,.....,.)).)))),)))).)))).))).........((((.(((((....................))))).)))).....{{{....}))......{{,((((((((((.(((......))).))....)))))))).,},.)))))))))..)))||{{....}},|{.(((((((((((((((.((.((.(((((((((.......(((......))},.,,.((((.....(((((((((((((.{....}))))).))))))))..))))....,,|||((({.(((,{((......,,,.(((......,..........},},))})),,,})}.,...))))))))).)))).)))).)))).))))))).)))))))))))))).,}}.))))})}))})}}|..{({((({{.,....,,,))))))},)))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GUAUAUGCUGAUCUUGCAUGCAGAGUAGACGCUGCACCGGUCUCCUUUU… 2946 nt 0.4077
GUAUAUGCUGAUCUUGCAUGCAGAGUAGACGCUGCACCGGUCUCCUUUU… 3299 nt 0.4077
GUAUAUGCUGAUCUUGCAUGCAGAGUAGACGCUGCACCGGUCUCCUUUU… 3226 nt 0.4067
CUCCCUAGUCGCGGGGAGUCUGAGAAAGCGCGCCUGUUUCGCGACCAUC… 3527 nt 0.4457
CUCCCUAGUCGCGGGGAGUCUGAGAAAGCGCGCCUGUUUCGCGACCAUC… 3653 nt 0.4451
CUCCCUAGUCGCGGGGAGUCUGAGAAAGCGCGCCUGUUUCGCGACCAUC… 3360 nt 0.4494
CUCCCUAGUCGCGGGGAGUCUGAGAAAGCGCGCCUGUUUCGCGACCAUC… 3300 nt 0.4491
Summary

This gene encodes glutamate dehydrogenase, which is a mitochondrial matrix enzyme that catalyzes the oxidative deamination of glutamate to alpha-ketoglutarate and ammonia. This enzyme has an important role in regulating amino acid-induced insulin secretion. It is allosterically activated by ADP and inhibited by GTP and ATP. Activating mutations in this gene are a common cause of congenital hyperinsulinism. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. The related glutamate dehydrogenase 2 gene on the human X-chromosome originated from this gene via retrotransposition and encodes a soluble form of glutamate dehydrogenase. Related pseudogenes have been identified on chromosomes 10, 18 and X. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.