Basic Information

Symbol
ABCC1
RNA class
mRNA
Alias
ATP Binding Cassette Subfamily C Member 1 (ABCC1 Blood Group) GS-X MRP1 MRP ATP-Binding Cassette, Sub-Family C (CFTR/MRP), Member 1 Glutathione-S-Conjugate-Translocating ATPase ABCC1 Multidrug Resistance-Associated Protein 1 Glutathione S-Conjugate Export Pump Leukotriene C(4) Transporter LTC4 Transporter ATP-Binding Cassette Transporter Variant ABCC1delta-Ex13&14 ATP-Binding Cassette Transporter Variant ABCC1delta-Ex25&26 ATP-Binding Cassette Sub-Family C Member 1 Multidrug Resistance Associated Protein 1 ATP Binding Cassette Subfamily C Member 1 EC 3.6.3.44 EC 7.6.2.2 EC 7.6.2.3 EC 3.6.3 DFNA77 ABC29 ABCC
Location (GRCh38)
16:15949138-16143257
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004996.4
Sequence length
6504.0 nt
GC content
0.5487

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2405.71 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2519.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1780.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004996.4 NCBI
GCCGCCGCCGCCGCCGCCAGCGCUAGCGCCAGCAGCCGGGCCCGAUCAC… 6504 nt 0.5487
NM_019862.3 NCBI
GCCGCCGCCGCCGCCGCCAGCGCUAGCGCCAGCAGCCGGGCCCGAUCAC… 6327 nt 0.5488
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra-and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This full transporter is a member of the MRP subfamily which is involved in multi-drug resistance. This protein functions as a multispecific organic anion transporter, with oxidized glutatione, cysteinyl leukotrienes, and activated aflatoxin B1 as substrates. This protein also transports glucuronides and sulfate conjugates of steroid hormones and bile salts. Alternatively spliced variants of this gene have been described but their full-length nature is unknown. [provided by RefSeq, Apr 2012]

Forensic Context

A study in humans identified the ABCC1 as having expression levels pleiotropically associated with sepsis through Summary data-based Mendelian randomization analysis [Yang et al. DOI:10.1111/jcmm.18559].