Basic Information

Symbol
GNAZ
RNA class
mRNA
Alias
G Protein Subunit Alpha Z Guanine Nucleotide Binding Protein (G Protein), Alpha Z Polypeptide Guanine Nucleotide-Binding Protein G(Z) Subunit Alpha G(X) Alpha Chain Gz-Alpha Heterotrimeric Guanine Nucleotide-Binding Protein 1H Transducin Alpha HG1H
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Cause of death analysis

MANE select

Transcript ID
NM_002073.4
Sequence length
3170.0 nt
GC content
0.5568

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1188.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1240.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 567.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...(((((....((((.((((((.((((((((((.((..((((..(((((.(((((((.(((...((((((((.(((((.((((((((...((..((......))..))))))))))...))))).))............)).)))).))).)))))..)).(((((....(((((..((........))...))))).....)))))((((.((.((.....)).)).))))....((..(((((((.(......).)))))))..)))))))..))))...((((((...)))))))).)))))))))).).))))))))).....).)))).))))))(((((((((.(((.(((...))).)))...((((..(((((...)))))..)))))))))((((((((((((((.((((((((....((((((......)).))))))).((((.(((((((((......((((((((.....))..)))))))))))))))..))))..((((((((((.......(((((..(((((((..........)))))))...((.((((...))))))(((((...)))))........))))))))).))))))))))).....))))))))))).)))(((((.....)))))...(((((((((((.((((((((......)))))).))............(((((...(((((...(((((........((......))......((((((((((((((((((((.......((((((((.((((.((((((....((((((..(((((((.((((.((.((((...))).).)).))))(((.(......).))))))))))..))))))..))).)))(((((((....)))))))....(((((.((........((((((.(.......)))))))......))))))).............((.((((((((((..(((((.((..........))))).))..)).....)))))))).))..........))))..)))))))).....(((((((.((..((((.....))))..)).))))))).(((((((((((((((..(((((......(((((((..(((((...(((((......)))............((((((.((((((....))..))))..))))))((((((((((((....(((((((((((((((((....).)))))))...)))))))..)).....))))))................)))))).((((........)))).))...)))))....))))))).......)))))))).))))))))))))....((((((((((.....((((...((((((((((........))))))).((.(((.((((((.(((((.....((((((...((((.....))))........(((.(......((....)).....))))...))))))...)))))..)))..))).))).))........)))..)))).)))))))))))))))).))..)).))))))))))...((((.(((((((..((..(((((.....)))))((((((((((....((((((....((((((((.......((((((.........))))))(((((((((..((((.(.(((((.((........((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((.((((.((.((.(((((((((((((((.((((((((.....(((((((((((((((.....))))))(((((((((((((..(((..(((....((((.(((((.(((((.(((.((..(((...((.((((((.(.......))))))).))...)))..)).))))).)))..)))))((((((((...((((((((......((((........)).)).(((((((((((.....)))))..))))))(.(((((((((.((((.((........))..))))))))))))).)(((.......))))))))))).....))..)))))).(((.........)))...))))....)))..)))..))))))))...((((((.......(((((((..((((.((((...)))).)))).((.....))........................)))))))..(((((((.(((.(((((...((((((....)))))).........))))).)))......))))))).....))))))....))))))))))))))......))))))))...(((.(((((((((......((((.......)))).......))))))))).)))(((((((.....((((.(((((........))))).)))))))))))............))))))))))........))))).)))).)).)).))))....))).)))))))).))))))))))(((.((((((((.....))))))))))).....((((((((.......))))))))...((((((.(((..(((((.((((...((((...........))))....)))).((((.(((((((....))))))).))))............((((......))))))).))..))).))))))((((((...)))))).........))))).))))))))..))))).)))).))))).).))))))))))))).))))))))(((((((((.(((((..((((((..(((((((....((((.(.((....)).).)))))))))))..))).))).....)).)))..))))))))).......((((.(.....).))))))))))...))))..))))))....))...))))))).))))(((((....))))).(((((((...(((((((.((((.....(.((........)).).....)))))))))))..))))))).((((((..((((...........))))..))))))...)).)))....)))))...)))))........)))).....)))))))......(((((.....)))))..............)))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((({{({({(....((((.(((((,.((((((((((.((..((((..(((((.({(((((.(((...((((((((.(((((.((((((((...((..((......))..))))))))))...))))).))............)).)))).))).)))))..)).(((((..{.(((((..((........))...))))).....)))))((((,(,.((.....)).)).))))....{{..(((((((.({.....),}))))))..)))))))..)))),..((((((...)))))))).)))))))))).,.))))))))).....},))})}.)))))((((((({,.(((.(((...))).)))..(((((..(((((...)))))..)))))..,.((((((((((((((.(((((((({{{.{(((((.,....)},)))}|||.((((.(((((((((......(((((({{.....,,.,)))))))))))))))..))))..,|||,,(((,......{(((((..(((((((..........)))))))...((.((((...))))))(((((...)))))........))))))))),))))),))))).....))))))))))).)))(((((.....))))}....,.{{{...{{|{.({((((.....,)))}))}))..|}}|,...}))))))..(((((({.,,(.(((.(..(((..,..(((({({(.{{((((((((((((((((((((.......((((((((.((((.((((((....((((((..(((((((.{(((.((.((((...})},}.)).)))}(((.{......).))))))))))..))))))..))).)))(((((((....)))))))....(((((.((......{.((((((.{.......}))))))}.....)))))))...........,.(({((((((((((..(((((.((..........))))),)).,)}.....)))))))),))).........))))..)))))))).....(((((((.((.,(({{....,)))}..)).))))))).{((((((((((((((..(((((......(((((((..(((((..,(((((......))}............((((((.((((((....)).,))))..))))))((((((((((((....(((((((((((((((((....),}))))))...)))))))..}}.....))))))................)))))).((((........)))),})...)))))....))))))).......)))))))).)))))))))))}....((((((((((.....((((...((((((((((........))))))).((.(((.((((((.(((((.....(({(({...((((.....))))....,,.,|||||.....,.,....},........},,.)))))),..))))},,})}..))).))}.}}........)))..)))).)))))))))))))))).))..))}))))))))))...((((.(((((((.{({..(((((.....))))|((((((((((....((((((...,{(((((((.......((((((.........))))))(((((((((.{((((.({(((((.{{....,,..((.(((({(((((((((((((((((((((((((((((((,,.{,{((((.((((.((.((.(((((((((((((((.{(((((({.....(((((((((((((((,..,.,}}}}}||||,((((((((..(((..(((..,{(((,.,(((({,,{((.(({.((..(((.,.((.((((((.(.......))))))).)).,.)))..)).))))).,))}}),,))|||{,((({{(((((((({...{{.{((((,..,,,.||||}.{(({{(({{{{,,...)})))),))))))},||||||||}}{({{,{{...{{{{{||..,,|||||}|,,,}.))}}}}}}))})||}})}}}||.....)}.}}})))).(({...,,....})),..)))}....)))..)))..))))))))...{(((((.......(((((((..{(({.((({...}))}.}))|.,,.....||..,,....................)))))))..(((((((.{((.(((((,..((((((....)))))).........))))).))}.,....})))))).....))))))....,}))),))))))))....,,))}}}||{((((((,((((((((,......((((.......)))).......))))))))).))))))|||......((((.{((((........))))}.))))},,,,,,............))))))))))........))))).)))).)).)).))))....})).)))))))).))))))))))(((.((((((((,...,))))))))))).,,,.((((((((.......))))))))...((((((.(((..({{((.((((.,.((((........,,.))))....)))),((((,(((((({....))))))).}}}}............{{((......}}}}))),))..))).)))))}((((((...)))))).........))))),})))))))..))))).)))),})))}}))))}}))))))))).)))))))|(((((((((.(((((..((({((..(((((((....((((.(.((....)).).)))))))))))..))}.))).....)).)))..))))))))),......{(((,{.....).))))))))))...)))}..,))))),...))..,))))))).))))(((((....))))).(((((((...(((((((.((((..{{{{.((....}}.},})).....)))))))))))..))))))).((((((..((((.........,.))))..))))))..,,,.......,,)))),.}))).....)))..).))).,.,)))))))......,{{{|,...,,}}}}...............{{.....)}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCCCCGCCCUGCCCGGAGCAGCUCGGCAGAUGCUCUGUGCUGCGGCCCG… 3170 nt 0.5568
Summary

The protein encoded by this gene is a member of a G protein subfamily that mediates signal transduction in pertussis toxin-insensitive systms. This encoded protein may play a role in maintaining the ionic balance of perilymphatic and endolymphatic cochlear fluids. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans using post-mortem tissue RNA sequencing demonstrated that the GNAZ gene was downregulated as part of the inhibited protein folding pathway in the lungs and brain of sepsis patients compared to uninfected controls [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].