Basic Information

Symbol
GNB1
RNA class
mRNA
Alias
G Protein Subunit Beta 1 Guanine Nucleotide-Binding Protein G(I)/G(S)/G(T) Subunit Beta-1 Transducin Beta Chain 1 Guanine Nucleotide Binding Protein (G Protein), Beta Polypeptide 1 Heterotrimeric Guanine Nucleotide-Binding Protein 2A Beta Subunit, Signal-Transducing Proteins GS/GI Testicular Tissue Protein Li 72 MRD42 HG2A MDS
Location (GRCh38)
1:1785285-1892292
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002074.5
Sequence length
3163.0 nt
GC content
0.5046

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1053.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1109.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1023.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001282538.2 NCBI
AGGGGCCCGCCGCGCCCAUCCCGAUGGCUGGAGGCGUCUGAGGGGCGGA… 3017 nt 0.5015
NM_001282539.2 NCBI
AGGGGCCCGCCGCGCCCAUCCCGAUGGCUGGAGGCGUCUGAGGGGCGGA… 3114 nt 0.5064
NM_002074.5 NCBI
AGGGGCCCGCCGCGCCCAUCCCGAUGGCUGGAGGCGUCUGAGGGGCGGA… 3163 nt 0.5046
Summary

Heterotrimeric guanine nucleotide-binding proteins (G proteins), which integrate signals between receptors and effector proteins, are composed of an alpha, a beta, and a gamma subunit. These subunits are encoded by families of related genes. This gene encodes a beta subunit. Beta subunits are important regulators of alpha subunits, as well as of certain signal transduction receptors and effectors. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2013]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic cocaine exposure and withdrawal in the nucleus accumbens led to a sustained down-regulation of several heterotrimeric G-protein β-subunits, including the GNB1 [Eipper-Mains et al. DOI:10.1111/J.1601-183X.2012.00873.X].