Basic Information

Symbol
GNB5
RNA class
mRNA
Alias
G Protein Subunit Beta 5 Guanine Nucleotide-Binding Protein Subunit Beta-5 Transducin Beta Chain 5 GB5 Guanine Nucleotide Binding Protein (G Protein), Beta 5 Gbeta5 Heterotrimeric Guanine Nucleotide-Binding Protein 2E Guanine Nucleotide-Binding Protein, Beta Subunit 5L G Protein, Beta Subunit 5L LDMLS1 LDMLS2 IDDCA LADCI HG2E
Location (GRCh38)
15:52115100-52191392
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016194.4
Sequence length
8934.0 nt
GC content
0.4772

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3076.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3232.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2433.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001379343.1 NCBI
GGGGGCGGUCGUGGCUGCGACGGGAGCCAGGCCCGCGCCACCGCCCGGG… 8684 nt 0.4788
NM_006578.4 NCBI
GCAUUCCCGCUCUCCGCUUCCCUCUCCGCUGCGUCCCCGCGCGAAGAUG… 8765 nt 0.4790
NM_016194.4 NCBI
ACACCUCAAGCUGCGCGCUGGUCCUCACCUCUCACCAUCUGCUCUGUGG… 8934 nt 0.4772
Summary

Heterotrimeric guanine nucleotide-binding proteins (G proteins), which integrate signals between receptors and effector proteins, are composed of an alpha, a beta, and a gamma subunit. These subunits are encoded by families of related genes. This gene encodes a beta subunit. Beta subunits are important regulators of alpha subunits, as well as of certain signal transduction receptors and effectors. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms exist. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human trauma patients demonstrated that the GNB5 mRNA was significantly downregulated in circulating CD3+ T cells during the injury stage compared to the recovery stage [Rau et al. DOI:10.2147/JIR.S375881].