Basic Information

Symbol
GNE
RNA class
mRNA
Alias
Glucosamine (UDP-N-Acetyl)-2-Epimerase/N-Acetylmannosamine Kinase Bifunctional UDP-N-Acetylglucosamine 2-Epimerase/N-Acetylmannosamine Kinase Uae1 IBM2 UDP-GlcNAc-2-Epimerase/ManAc Kinase GLCNE UDP-N-Acetylglucosamine-2-Epimerase/N-Acetylmannosamine Kinase UDP-N-Acetylglucosamine 2-Epimerase/N-Acetylmannosamine Kinase N-Acylmannosamine Kinase THC12 DMRV NM
Location (GRCh38)
9:36214441-36277042
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005476.7
Sequence length
5263.0 nt
GC content
0.4547

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1887.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1985.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 968.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((..((((((......))))))...(((.(((((((((.........))))))))).))).(((((..((((.((.((((....).))).)).((((.(((.(((((...))))).))).)))).((...(((......))).)).......))))..)))))......(((...(((((((.(((((........(((((((..(.(((((.....))))))((..(((....)))..)).........(((.((((((........)))))).)))((((...))))(((((((((.(((.((((.(..(((..(((((..................)))))..)))..)..))))...))).)))))))))......((..((((((..(((((((((....(((((((((((..((((((..(((.((((......)))).)))..))))))(((.......)))((.(.(((((((...((((((....))))))...))))))).).))..((((....)))).....))))))).......))))....))))))))).....(((((((..(((((((....)))))))..)))))))......((((.........)))).........))))))..)))))))))(((((((((((..(((.((((....)))).)))(((((((..(((.((....((((((.(((((((((((.((((...((.(((((.((.(((.......(((((((...........))))))).((((((((((((((..(((....)))))))))))))).)))......((((((.((..(((......((((.(((.....(((((......))))))))))))............(((((((.(....((((((((.(((((........(((((((((((((((.(((((((.((.((.((((((((..(((...(((...))).)))..)))))))))).)).))).))))........((((((.(((((((((((.......)))))))))))))))))..((((...))))(((((((.((((((....)))))).)))).)))(((.((.......)).)))((((((..((.........((((((((....))))).((((.(((.((....)))))..))))......((((.....))))...((((((((((...((((((((((.((....(((((((((...((((((((((.((((..((.((((((((..((...........)).)))))))).)).........((((((((((.((((((((....)))))(((((((....))))))).......(((((((.(((((..((((..((((.(((((.(((((.((......)).))))).).)))).))))))))..))))).......))))))).....(((..((((.............))))..)))(((((...)))))(((((......)))))....((((((....)))))).....)))..)))))))))).))))..)))))))))).......)))))))..))...)).))))....))))))......))))))))))(((((((((...))))).))))))).........))..)))))).))))))...)))))))))(((((((((.((....))..))).))))))((((.(((......))).)))).)))))))))))))....))))))))......)))..))))))))....(.(((((((....))))))).)...........((((((((...))))))))((.(((((((((((..((..((((((((((.((..((((((((..(((.(.((((..((((.((((((......))))....(((((((..((..(((((.(((((((.........(((((.(.(((......))).).))))).(((((((((..(((((....((.((((.((((((.(......).)))))))))).))....)))))(((.(.((((((((((((.(((...........)))...)))))))))))).).))).)).)))))))..............)))))))))))).))..))))))).))))))...(((((((((((((...(((...))).......(((....)))...(((((......))))))))))))))))))...((((((((((((.....(((.((((((......)))))).)))...(((((......(((.(((((.((.((.((.....(((..((....))..)))....)).)))).))))).)))......)))))......((((((........))))))))))))))))))(((......)))((((((((((((.((((......................)))).)))))))))))).......((((((((.((((((.((((..((.....))(((...(((((.((((................)))))))))..)))(.((((......)))).)..)))).)))))).))))).))).((((..............))))...............)))).).)))..))))))))..)).)))))))....(((((..(((((.(.(((....((.((((((.(((((((....((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((..(((((((.(..((....))))))))))..((((......))))((((..(((((((((........................(((((((((.(((.(.(((((((....((((((.(((((..((((....((.((.(((....((((((((...((((((...((......)).)))))).)))).)))).)))..))..))....)))).)))))......((........))..............................)))))))))))))).).)).)).)))))))((..((((((....)))))).)).)))))))).)..))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..(((.(((((((((((((.((((((...........(((((((((((.((((((((((((((.(((((.((((((............((((....................(((((.(((((......((((((.....))))))((((((((.(.(((.((....((((.(((((.((((((((.............(((((...((((((.......))))))......)))))))))))))......((.(((((.((((((((((......((((((((((..((..((((((................))))))..))...(((((((((((.(((((......))))).)))).((((((..((((((....(((((((((....((((.(((((.(..(((((((((((((.....((((((.........))))))))))))..)))))))..).))))).)))).....(((((((..((........)))))))))((((((((.....(((....)))....))))))))......((((......))))(((((....)))))....)))))))))))))))...))))))..((......))...))))))).)))))...))))).)))))))))).))))))).........(((((......)))))............)))))))))....))..))).(((((..........((((((((((((..((((.((......)).))))..))))))..............((((.....))))))))))((((((............)))))).)))))).))))))))........))))).)))))((((((((((....)))).))))))(((.(((((....((((...........))))...))))).))).......(((....)))........(((((..((((((...........(((((((....(((((..((.....((.....)).......))...)))))..((((..........)))).....((((((((....))).)))))))))))))))))))))))...))))............))))))))))).)))))))))))))).))))))))))))))))).))))))))))))).)))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))....))))))).))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))).))))))....)))))))...).)).))).))..))).).)))))..))))).....(((((.(((((.......((((((..((((((...))))))..)))))).........))))).)))))...((((((((....(((.....))).......))))))))....((((((((((.((((((.((((....(((((((((......))..)))))))((((((((((.((....)).))))).)))))...(((....)))...)))).)))))))))))))))))))..))..)))))).)))))))))).)).))))).)))))).))))))))).))))))))....)))))......))))))).....)))))))))))....((((..(((((((((((((((.(((((((((..............))))).)))).))........((((((((((((.............))))))))))))........((((....))))...))))..))))).)))))))).((((((......))))))....))))).)))))))...)))........)))..........(((......))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{...((((((......))))))...(((.(((((((((.........))))))))).))).(((((.,((((.((,({{{.,,,).)}).}}.((((.(((.(((((...))))).))).)))).((...{{{......})}.,,,,.....)))),.)))))......(((...(((((((.,,(((,.,,,.,,(((((((..{.(((((.....)))))}{,{{((,,,..,,,..},,}}}.....{((.((((((........)))))).))|((((...))))|{{{((((({(((,((((.,,,(((..(((({..,,..{{({......)}))))}..}}}..}..}}}),}.}}}.}))))))},...,,|((..((((({..{((((((((....(((((((((((..{(((((.,(((,{((({,,,||}}}}.}}}.,))))))|,{,.,.....,}{{.{.(((((((...((((((....))))))...))))))).}.))..||||,,,.))))}}}}.))))))),......))))....})))))))}.,}..(((((((..(((((((....)))))))..))))))).,....||||,..,.....}}||.,,,.....})))}),,)})))))))|((((((((((..(((.((((....)))).)))(((((((,.(((,({....((((((.(((((((((((.((((...{{.(((((.((.(((.,..,{.(((((((.{.......}.)))))))}|(((((((((((((,.,((....)))))))))))))).)),{{{{,.((((((.((..(((......((({{(({....,(((((......))))))))))))............(((((((.(....((((((((.{((((........(((((((((((((((.(((((((.((.((.((((((((..(((...(((...))).)))..)))))))))).)).))).)))){{{,{{{{({{(((({{{((((((((,.,.,,.|||}}||||}}}}}}}}..||||,,,)}))|({((((.((((((....)))))).)))).))}{{|,||},..,}.)),),,||||||..||...,{,,..{((((,(,..,,}}}},.((((.(((.((....)))))..))))......((((.....))))...((((((((((...((((((((((.({,...{{({(((((,..((((((((((.((((..((.((((((((..{{...........)).)))))))).)).........{(((((((((....(((((....)))))(((((((....))))))),,..{{{(((((({.(((((..((((..((((.(((({.(((((.((......)).))))).}.)))).))))))))..))))).......}))))}},}}}..||(((({({((({.....,,........))||||.......||({(((....,})),))}...((((((....))))))...,}))),,)))))))))),)))}..)))))))))).......))))))}.,}},,.}).))))....))))))...,..))))))))))(((((((((...))))).)))),,...}}.}}}})),,)))}}}.))))))...)))))))))(((((((((.{{....,,..))).))))))((((.(((......))).)))).))))}))))))))....))))))))......)))..))))))))....(.(((((((....))))))).)...........{{((((((...))))))))}}}(((((((((((..((..((((((((((.((..((((((((..(((,(.((((..{{{{.{(((((,.....||}}....(((((((..((..((((({(((((((.......{.((({{.,.{{|,,....)||.|,|||}}.(((((((({.,(((({....{(.((((.((((((.{......).)))))})))}.,,....))))}|((.(.((((((((((((.(((...........)))...)))))))))))).).))},)),}))))))...},,,}.},...)))))))))))).))..))))))).}}}}))...{((((((((((((..,(((...)))}......(((....)))...(((((......)))))))))))))))))},.,((((((((((((.....(((.((((((......)))))).)))...((({{......(((.(((((.((.{{,((...,,(((..{(....)),,}}}..,.}}.)))).))))).)))......)))))..,,..{(((((........)))))}))))))))))))|{{......,},((((((((((((.((((....,...........,,....)))).)))))))))))).,,,...((((((((.((((((.((((..,,.....||{({...(((((.((((................)))))))))..})}{.((((......)))).,..)))).)))))).))))),)})}|||,,,,,..,|.....,}}}|,{....))),,....)))).).)))..))))))))..)).)))))))....(((((..(((((.(.(((.{{.{(.((((((,(((((((....((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((..(((((((.(..,,....),,)))))))..((((......))))((((..(((((((((..{{...............,.|..(((((((((.(({.(.(((((((....((((((.(((((..((((....((.((.(((,...{(((((((...((((((...((......,,.)))))).)))).)))).)})..))..))....)))).)))))................................................)))))))))))))}.).)).)).)))))))||..((((({....}))))).}..)))))))).)..))))((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((((((((((((((((((((((((((((((((,{(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..(((.(((((((((((((.((({{,........,,{(((((((((((.((((((((((((((.(((((.((((((.,,.........,{{{.,..........,{{{({{{((((..,{,{..{({..((((((.....)))))).|||,,|,,...}}}}},....,,,.,,|||}|||(((((,,.........,{{,{{{{{{({,,,,.,},,,,))))),........,,.}}})}}||,,{...{{.({({(.((((((((({......,{{{{{(({{..((,.((((((................})))}}..,,...,{{{{{|{(((.(((((......))))).}}}}.((((((.,((((((,...{((((((((,...{(((.(((((.{..(((((((((((((.....((((((.........))))))))))))..))))))).,}.))))).)))}.....{(,{({....,}}}},...,}}}}}}},((((((((...{.(((....)))....))))))))......((((......)))}(((((....)))))...,))))))))))))))),,.))))))..{{,,,.,,||,,,||||||,.,))))...))))),))))))))}}.))}||||.,,,,{,..{((((......})))}.,|,,,|||,,,,,||||||,,,,,|,..||{,||,(({{{...}||}|,,,,.,|||{|,.||||,||,...,,))})))},,})}}}}...........(((((((.....))))))))}}|,,,||,..,,,||...,})))}},}}))))})}))}}|||,.,|{{.|||||{|||||((((((((((....)))).))))))(((,(({{{....,{||,..........},}}...}}}}}.}}}.....,,{{|....,,,.........,,|}}||||||{,,.........{{{{{{{,,,.|{{{{..||,,,.,{{.....}}.....,,,,...}}|}||.{{,,....,.,,,,}},,.....,||||{||....}}},})))})))))))))))))))))).}}))))..........}}))))))))))).)))))))))))))).))))))))))))))))).))))))))))))).)))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))},..,}))))))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))).))))))....)))))))...).)).)))}},},))).).)))))..))))).....(((((.(((({.......((((((..(((((,...,)))))..))))))........,)))}}.)))))...((((((((....(({.....}}}.......))))))))....((((((((((.((((((.((((....(((((((((......})..)))))))((((((((((.((....)).)))))},))))...,{{....}},...)))).)))))))))))))))))))..))..)))))))})))).}))).)).))))).}})))).))))))))).))))))))....))))).,....))))))).....))))))))))}....((((..(((((((((((((((.(((((((((...........,..)))))},))).))........((((((((((((..,,......,}.))))))))))))........((({....})))...))))..))))),}))))))).((((((......))))))..,})}))),)))))))...)))...,,...,}},..........,,.,,..,}},.,,..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001128227.3 NCBI
AAACCACACUAGGGUACAGAGCUCGUGCUUCGGGAUGGAAACCUAUGGU… 5220 nt 0.4483
NM_001190383.3 NCBI
GUCUACCCGCGCGCCCGAGCGCGGAAACCGAGGGGCAGGCUCGCGCUCU… 5041 nt 0.4527
NM_001190384.3 NCBI
GUCUACCCGCGCGCCCGAGCGCGGAAACCGAGGGGCAGGCUCGCGCUCU… 4904 nt 0.4592
NM_001190388.2 NCBI
AAACCACACUAGGGUACAGAGCUCGUGCUUCGGGAUGGAAACCUAUGGU… 5014 nt 0.4499
NM_001374797.1 NCBI
GUCUACCCGCGCGCCCGAGCGCGGAAACCGAGGGGCAGGCUCGCGCUCU… 5110 nt 0.4571
NM_001374798.1 NCBI
GUCUACCCGCGCGCCCGAGCGCGGAAACCGAGGGGCAGGCUCGCGCUCU… 5057 nt 0.4566
NM_005476.7 NCBI
GUCUACCCGCGCGCCCGAGCGCGGAAACCGAGGGGCAGGCUCGCGCUCU… 5263 nt 0.4547
Summary

The protein encoded by this gene is a bifunctional enzyme that initiates and regulates the biosynthesis of N-acetylneuraminic acid (NeuAc), a precursor of sialic acids. It is a rate-limiting enzyme in the sialic acid biosynthetic pathway. Sialic acid modification of cell surface molecules is crucial for their function in many biologic processes, including cell adhesion and signal transduction. Differential sialylation of cell surface molecules is also implicated in the tumorigenicity and metastatic behavior of malignant cells. Mutations in this gene are associated with sialuria, autosomal recessive inclusion body myopathy, and Nonaka myopathy. Alternative splicing of this gene results in transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.