Basic Information

Symbol
GNG2
RNA class
mRNA
Alias
G Protein Subunit Gamma 2 Guanine Nucleotide-Binding Protein G(I)/G(S)/G(O) Subunit Gamma-2 Guanine Nucleotide Binding Protein (G Protein), Gamma 2 G Gamma-I Guanine Nucleotide-Binding Protein G(I)/G(O) Gamma-2 Subunit Heterotrimeric Guanine Nucleotide-Binding Protein 3F1 Guanine Nucleotide Binding Protein Gamma 2 HG3F1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation

MANE select

Transcript ID
NM_053064.5
Sequence length
3573.0 nt
GC content
0.3999

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-923.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -992.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1094.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
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AGUGUCUUCCUCCCUCAGCUUGUGCAGCUGCUUUCAGGAUAACCUCAGA… 3461 nt 0.3877
AGUCCCUGGGCUGCAGCCGCUGCUACACAUACUCACAACGCUGCCGCCG… 3573 nt 0.3999
Summary

This gene encodes one of the gamma subunits of a guanine nucleotide-binding protein. Such proteins are involved in signaling mechanisms across membranes. Various subunits forms heterodimers which then interact with the different signal molecules. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

A study in human brain samples using RNA-seq data and machine learning identified the GNG2 as a downregulated gene marker involved in the glutamatergic synapse pathway, GABA receptor activation, and morphine addiction, contributing to a classification model for Major Depressive Disorder and its suicidal subtype [Verma et al. DOI:10.007/s11571-021-09724-8].