Basic Information

Symbol
GNPTG
RNA class
mRNA
Alias
N-Acetylglucosamine-1-Phosphate Transferase Subunit Gamma C16orf27 GNPTAG UDP-N-Acetylglucosamine-1-Phosphotransferase Subunit Gamma N-Acetylglucosamine-1-Phosphotransferase Subunit Gamma GlcNAc-1-Phosphotransferase Subunit Gamma C316G12.3 CAB56184 N-Acetylglucosamine-1-Phosphate Transferase Gamma Subunit N-Acetylglucosamine-1-Phosphotransferase, Gamma Subunit GlcNAc-Phosphotransferase Gamma-Subunit Chromosome 16 Open Reading Frame 27 LP2537 RJD9
Location (GRCh38)
16:1351931-1365737
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032520.5
Sequence length
1975.0 nt
GC content
0.5772

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-737.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -776.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 447.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_032520.5 NCBI
ACUUCACGUGACCGCGCGGCGGCCGCUGCGGCGCGAUGGCGGCGGGGCU… 1975 nt 0.5772
Summary

This gene encodes the gamma sunbunit of the N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase complex. This hexameric complex, composed of alpha, beta and gamma subunits, catalyzes the first step in synthesis of a mannose 6-phosphate lysosomal recognition marker. This enzyme complex is necessary for targeting of lysosomal hydrolases to the lysosome. Mutations in the gene encoding the gamma subunit have been associated with mucolipidosis IIIC, also known as mucolipidosis III gamma.[provided by RefSeq, Feb 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly upregulated the GNPTG in oligodendrocytes, where it is associated with the lysosome pathway [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].