Basic Information

Symbol
GOLGA2
RNA class
mRNA
Alias
Golgin A2 Golgin-95 GM130 Golgi Autoantigen, Golgin Subfamily A, 2 130 KDa Cis-Golgi Matrix Protein Golgin Subfamily A Member 2 Golgi Matrix Protein GM130 GM130 Autoantigen SY11 Protein DEDHMB
Location (GRCh38)
9:128255829-128276026
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001366244.2
Sequence length
4359.0 nt
GC content
0.5483

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1684.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1760.48 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 931.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001366244.2 NCBI
GACUUCCGCAGUGGUUGCCGGGAUCGCGCUGAUGUGGCCCCAACCCCGC… 4359 nt 0.5483
NM_001366246.2 NCBI
GACUUCCGCAGUGGUUGCCGGGAUCGCGCUGAUGUGGCCCCAACCCCGC… 4278 nt 0.5500
NM_001389695.2 NCBI
GACUUCCGCAGUGGUUGCCGGGAUCGCGCUGAUGUGGCCCCAACCCCGC… 4344 nt 0.5481
NM_001389696.2 NCBI
GACUUCCGCAGUGGUUGCCGGGAUCGCGCUGAUGUGGCCCCAACCCCGC… 4341 nt 0.5473
NM_001389697.2 NCBI
GACUUCCGCAGUGGUUGCCGGGAUCGCGCUGAUGUGGCCCCAACCCCGC… 4266 nt 0.5504
NM_001389698.2 NCBI
GACUUCCGCAGUGGUUGCCGGGAUCGCGCUGAUGUGGCCCCAACCCCGC… 4260 nt 0.5491
NM_001389699.2 NCBI
GACUUCCGCAGUGGUUGCCGGGAUCGCGCUGAUGUGGCCCCAACCCCGC… 4239 nt 0.5518
NM_001389700.2 NCBI
GACUUCCGCAGUGGUUGCCGGGAUCGCGCUGAUGUGGCCCCAACCCCGC… 4239 nt 0.5501
NM_001389701.2 NCBI
GACUUCCGCAGUGGUUGCCGGGAUCGCGCUGAUGUGGCCCCAACCCCGC… 4197 nt 0.5502
NM_001389702.2 NCBI
GACUUCCGCAGUGGUUGCCGGGAUCGCGCUGAUGUGGCCCCAACCCCGC… 4173 nt 0.5480
Showing 1 to 10 of 14 entries
Summary

The Golgi apparatus, which participates in glycosylation and transport of proteins and lipids in the secretory pathway, consists of a series of stacked cisternae (flattened membrane sacs). Interactions between the Golgi and microtubules are thought to be important for the reorganization of the Golgi after it fragments during mitosis. This gene encodes one of the golgins, a family of proteins localized to the Golgi. This encoded protein has been postulated to play roles in the stacking of Golgi cisternae and in vesicular transport. Several alternatively spliced transcript variants of this gene have been described, but the full-length nature of these variants has not been determined. [provided by RefSeq, Feb 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GOLGA2 was validated as a mis-spliced target in the hearts of cardiomyocyte-specific Mbnl1/Mbnl2 double knockout animals, which recapitulate myotonic dystrophy cardiac pathology and sudden death [Lee et al. DOI:10.1093/hmg/ddac108]. The splicing alteration for this vesicular trafficking-associated mRNA was strictly concordant between RNA-sequencing and RT-PCR validation.