Basic Information

Symbol
GOLPH3
RNA class
mRNA
Alias
Golgi Phosphoprotein 3 GPP34 MIDAS GOPP1 Vps74 Golgi Peripheral Membrane Protein 1, 34 KDa Mitochondrial DNA Absence Factor Golgi-Associated Protein Coat Protein GPP34 Golgi Protein Coat-Protein Golgi Phosphoprotein 3 (Coat-Protein)
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_022130.4
Sequence length
2678.0 nt
GC content
0.4455

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-801.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -854.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 680.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........((((((....(((((.....((((((((.(((((((...(((((.....((((....((((((((((....))).)))))))..))))...)))))...))))...(((((((..(((.(((((((.((.(.(((((((((......)))).(((((((((...)))))))))((((.....(((....))))))))).))).))).)))))))))))))))))(((.(((((((((((.....((.((((..(((((.((((.(((((....)))....((((((((..((.((((......((((((((((......))))).))))).(((((..(((((((..(.....)..))))))).)))).))))).))...))))))))..)).)))).))))))))).))...))))))).....))))..))))))))))))))....)))))(((((((...((((......))))(((.((.((....)).)))))))))))).((((.(((..(((((..((.....(((((((((....((((((..((((((((...))))))))..(((((((((............((..((((((((((((......)))).......(((((((..(((((.....))))).((((....))))......((((((((((.((.(((....(((((.(((........))).......(((((((....)))))))......(((.(((((((..((((...))))......((((((.((......))))))))......(.(((((........))))).)....((((((.(((.((.((((((...((......))..))))))...)).))).)))))).))))))).))).)))))....))).)).)))))))))).((.((((((....)))))))).....((((((((.((.(((((((.........(((((((.((.(((((((....((((((((((...(..(((((.(((((..((....))...))))).)))))..).)))))..((((...))))(((((.((....)))))))...((((((((......))...)))))).))))).....))))))).)).)))))))))))))).)))))))))).((((....)))).((((((...)))))))))))))....((.(((((((.((((...........)))).))))))).))(((.....)))...((((..(((.((((((((.((((...((((..((((((((((((((((......((((((((((((((((((.(((((...((((((....)))))).......................(((((...)))))................(((((...((((....(((...(((...((((..((((((((...))))))))...))))...)))...))).)))).....)))))...)))))..)))))).......))))))))))))....((.(((((.((.......)).)))))))....))))))))....)))))))).(((((........)))))....(((((((((..............((((((.(((.((((..((.......................))..)))).)))))))))..))))))))).(((((((((((.......))))).....((((....))))...((((......)))).......))))))))))...)))))))))))))))..))))...))))))))....))((((((((((....)))))))))).......)))))))))))))))...(((..((((((.((((((((((((((...((((..(((.((((((((.(((((.(((((((((((((((((.......(((......)))(((.....)))(((...(((.(((((((.((......((.(((((((.((((........(((..((((((....)))))).))).((((.....((((.....((((..((....((((...........))))....))..))))..))))..))))......)))).)))))))..))...))))))))).)))...)))....(((((((((((..((..((.(((((.....((((........))))..........))))).)).))..)))))))))))))))...))))).))))))).(((((.((((...(((((((.(((((....((((......(((...((((((((((..........))))))))))...)))...........((((((.((((.....))))))))))..))))...))))).))).)))).))))))))).(((...)))((((..(((((.....)))))..))))......................(((((.(((.....))).)))))).)))))..)))))))).))).)))).....(((((....))))).)).)))).)))))))))))))).)))....))))))..)))......))..)))))..))))))).((((.((.........)))))).......................))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....,{,,((((((((((((((((.((((((,(((({(((,(((({,,{{(({.,.,((((....((((((((((....))).)))))))..))})...)))||{{{{|||{,.(((((((..(((.(((((((.((.(.(((((((((......}||}.(((((((((...))))))))),,,,.....(((....)))},}))).))).))).)))))),)))))))))}{{{.(((((((((((...,.((.((((..(((((.((((.(((((....)))....((((((((.,((.((((.,,...((((((((((......))))).))))).,((((..(((((((..{.....}..))))))).)))),,)))).))...)))))))).,)).)))).))))))))).)).,.))))))).....))}}..)))}},}||},}}),..,|||||{|,((({{.{((((...{{{||||{{|,|||{{....)}.))}}|||||{|||(({(((((....})))).)))....{{(((((,{{{{..,,((,.{(((((((...,}}}}|||,,||,,,,({((({{..,,.....(((((..{({.((((......))))})}.)))))...,}}}|||||}}}.,))))))}}||}.}})))},,,|}|||||||{||{.((.|{{...,|{|||,|{|,....}}})))}},},..(((((((....)))))))......{{{.(((((((..{{{{...})}}......((((((.((......)))))))){(,...},.,..,.......,}}}}}|}....((((((.(((.((.((((((...{(......}}..))))))...)).))).)))))).))))))).,,,.,}}},..,,|||,||,|}}||}}}},.{{.((((({....))))))}}..,,(((({{...,,,,))})).)}}}}..}))))},,)))||}||||,,....,|(({....((|((({{(((((..(((({.(((.{(((..(((({.(((...{{(,{......}||})}.))).))))).)))).)))))))).{{(({{...|,.},}})),,})))))},))),}}}}))..))))})))},.)))))),)))))))))|{(((((.((((....})))..,)))))}}......}}}}},,....((.(((((((.((((........,..)))).))))))}.)),......{{{|,,,{,.,..,,.....((((((((((({.,,,...,{(((((((({{,...,,....((((((((((((((((((.(((((...((((((....))))))........,.,,,.....,,,,.(((({...}))))....,.........,.(((((...{{((....{((...(((...((((..((((((((...))))))))...))))...))).}.))).)))).....)))))...,))))..)))},,.,,,...))))))))))))...}},..,)))))},,.,,..)))))))))))}...,,}}|||,,....,,,,,.,||||,........}},}}.,{{(((((((.((((..,,.(((((((.,(((((((((((,,,,,.........,,,....{{{{{{,|...|||,...,,,,,,|,,,,.,,||||.,((((((((((.......)))))}}},.{(((....)))},,,{(((,,....}}}},...,})}}..,,})))}}}),,|.(((((...((({.(((..((((.......))))((((((((((....)))))))))).....})),,}}}.)))))}.....{{{..((((({,((((((((((((((...{(((..(({.((((((((.(((((.,((((((((((((((((.,,,,,{{|||||,..,.|{{{.....)))|{{...(((.((((((((((......{{.(((((((.((((........(((..((((((....)))))).},,.(({{...|.((((.....((((..((.,..((((...........))))..,.))..))))..))))..))))......)))).)))))))..}}...))))))))).))).,,))}....(((((((((((,,((..({.{((((.....((({........)))),......,,.}}))},)),}}..)))))))))))))))...))))).))))))).(((({{((((...(((((((.(((((....((((,{{,,.(((...((((((((((.,......,.))))))))))...))).,,}}..,,..{((((,,{{{{.....})))))))})..})))...))))).))).)))).))))))))).{,{..,}||((((..(((((.....)))))..)))}...,..,,,|......,,,..,(((((.(((.....))).)))))).)))))..)))))))).))).)))}.....(((((....))))).,}.))))))))))))))))))).)}},{{{,...,)))}}....,,.{(((...)))).....)))))).))))}.....)))))))..,,..)))).)))).)))))),}))))}}...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AUAUUGGAAAGGCGCCGCCGCCGCCUCCGCCUUGGAGCUCGGGGUGUUU… 2678 nt 0.4455
Summary

The Golgi complex plays a key role in the sorting and modification of proteins exported from the endoplasmic reticulum. The protein encoded by this gene is a peripheral membrane protein of the Golgi stack and may have a regulatory role in Golgi trafficking. Several alternatively spliced transcript variants of this gene have been described, but the full-length nature of these variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.