Basic Information

Symbol
GOLT1A
RNA class
mRNA
Alias
Golgi Transport 1A CGI-141 YMR292W GOT1 Vesicle Transport Protein GOT1A FLJ42654 MGC62027 HGOT1b GOT1B Golgi Transport 1 Homolog A (S. Cerevisiae) Golgi Transport 1 Homolog A HMFN1187
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference

MANE select

Transcript ID
NM_198447.2
Sequence length
776.0 nt
GC content
0.5528

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-275.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -290.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 190.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
GUGACCAUGUACCAGCUGCGUCCUCUGGGCCACGCUCCACUUGCCCGCU… 776 nt 0.5528
Summary

Predicted to be involved in endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport. Located in Golgi apparatus subcompartment; endoplasmic reticulum; and nuclear envelope. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GOLT1A transcript, a vesicle transport protein, increased in abundance at 1 hour postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].