Basic Information

Symbol
GOT1
RNA class
mRNA
Alias
Glutamic-Oxaloacetic Transaminase 1 Glutamate Oxaloacetate Transaminase 1 AST1 SGOT AST Glutamic-Oxaloacetic Transaminase 1, Soluble Aspartate Aminotransferase, Cytoplasmic Cysteine Aminotransferase, Cytoplasmic Cysteine Transaminase, Cytoplasmic Aspartate Aminotransferase 1 Aspartate Transaminase 1 Transaminase A EC 2.6.1.1 CAspAT CCAT Glutamic-Oxaloacetic Transaminase 1, Soluble (Aspartate Aminotransferase 1) Testis Secretory Sperm-Binding Protein Li 196a Growth-Inhibiting Protein 18 EC 2.6.1.3 ASTQTL1 GIG18
Location (GRCh38)
10:99396870-99430671
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002079.3
Sequence length
1978.0 nt
GC content
0.4894

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-616.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -654.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 669.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002079.3 NCBI
AGACCUGACCUGCCAGCUCCGGGCGUGGGGUGAAAUCUCUUGAUUCCUA… 1978 nt 0.4894
Summary

Glutamic-oxaloacetic transaminase is a pyridoxal phosphate-dependent enzyme which exists in cytoplasmic and mitochondrial forms, GOT1 and GOT2, respectively. GOT plays a role in amino acid metabolism and the urea and tricarboxylic acid cycles. The two enzymes are homodimeric and show close homology. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GOT1 mRNA was down-regulated (0.27-fold) in bone marrow cells 6 hours after a 6.5 Gy whole-body ionizing radiation exposure [Dai et al. DOI:10.1080/09553000600857389].