Basic Information

Symbol
GP9
RNA class
mRNA
Alias
Glycoprotein IX Platelet GPIX Platelet Glycoprotein IX CD42a Glycoprotein 9 Glycoprotein IX (Platelet) CD42a Antigen GP-IX
Location (GRCh38)
3:129060779-129062435
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000174.5
Sequence length
877.0 nt
GC content
0.6705

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-406.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -420.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 211.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000174.5 NCBI
AUAGAGUUGCCACCCAGGCCUCAGCCAGGACCUUUCAGGCCAGACAGGA… 877 nt 0.6705
Summary

This gene encodes a small membrane glycoprotein found on the surface of human platelets. It forms a 1-to-1 noncovalent complex with glycoprotein Ib, a platelet surface membrane glycoprotein complex that functions as a receptor for von Willebrand factor. The complete receptor complex includes noncovalent association of the alpha and beta subunits with the protein encoded by this gene and platelet glycoprotein V. Defects in this gene are a cause of Bernard-Soulier syndrome, also known as giant platelet disease. These patients have unusually large platelets and have a clinical bleeding tendency. [provided by RefSeq, Oct 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GP9 mRNA was significantly dysregulated in lung tissue following 12 Gy thoracic irradiation and was functionally annotated to the hematopoietic cell lineage pathway according to KEGG analysis [Li et al. DOI:10.1177/1559325819891012].