Basic Information

Symbol
GPAT2
RNA class
mRNA
Alias
Glycerol-3-Phosphate Acyltransferase 2, Mitochondrial CT123 1-Acylglycerol-3-Phosphate O-Acyltransferase GPAT2 Cancer/Testis Antigen 123 EC 2.3.1.15 EC 2.3.1.51 GPAT-2 XGPAT1
Location (GRCh38)
2:96021946-96039451
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001321527.2
Sequence length
2743.0 nt
GC content
0.6066

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1248.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1293.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 582.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001321525.2 NCBI
AGUCCACGCCUUGUGGCGGCUUUGCGGAGCUGCUGCUUUGGCGGGAGUU… 2689 nt 0.6084
NM_001321526.2 NCBI
AGUCCACGCCUUGUGGCGGCUUUGCGGAGCUGCUGCUUUGGCGGGAGUU… 2779 nt 0.6089
NM_001321527.2 NCBI
AGUCCACGCCUUGUGGCGGCUUUGCGGAGCUGCUGCUUUGGCGGGAGUU… 2743 nt 0.6066
NM_001321528.2 NCBI
AGUCCACGCCUUGUGGCGGCUUUGCGGAGCUGCUGCUUUGGCGGGAGUU… 2733 nt 0.6070
NM_001321529.2 NCBI
AGUCCACGCCUUGUGGCGGCUUUGCGGAGCUGCUGCUUUGGCGGGAGUU… 2566 nt 0.6076
NM_001321530.2 NCBI
AGUCCACGCCUUGUGGCGGCUUUGCGGAGCUGCUGCUUUGGCGGGAGUU… 2458 nt 0.6070
NM_001321531.2 NCBI
GUUUUUCAGCGUCAGAGUCUCAGGAUCUCGAUGUGGACAGGCACCCUGA… 2808 nt 0.6100
NM_001389639.1 NCBI
AUAACAAAAUACGUUUCUUCCAAAGAAGCAGCACAUCUGACAGCUGAAC… 3004 nt 0.5985
NM_207328.4 NCBI
AGUCCACGCCUUGUGGCGGCUUUGCGGAGCUGCUGCUUUGGCGGGAGUU… 2761 nt 0.6088
Summary

Enables glycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity. Predicted to be involved in glycerol-3-phosphate metabolic process; glycerolipid biosynthetic process; and piRNA processing. Located in mitochondrion. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in pigs demonstrated that the GPAT2 gene, a marker for glycerophospholipid metabolism, was uniquely upregulated in the skeletal muscle of cold-tolerant Tibetan pigs following a 3-day cold exposure (4°C) compared to cold-sensitive Bama pigs, indicating a breed-specific transcriptional response to cold stress [Yang et al. DOI:10.3390/ijms24087431].