Basic Information

Symbol
GPCPD1
RNA class
mRNA
Alias
Glycerophosphocholine Phosphodiesterase 1 GDE5 KIAA1434 GDPD6 Glycerophosphocholine Phosphodiesterase GPCPD1 Glycerophosphodiester Phosphodiesterase 5 Glycerophosphocholine Phosphodiesterase GDE1 Homolog (S. Cerevisiae) Putative Glycerophosphocholine Phosphodiesterase GPCPD1 Glycerophosphocholine Phosphodiesterase GDE1 Homolog Putative Glycerophosphodiester Phosphodiesterase 5 Endometrial Differential 3 Preimplantation Protein 4 EC 3.1.4.2 PREI4 EDI3
Location (GRCh38)
20:5544404-5611045
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_019593.5
Sequence length
5434.0 nt
GC content
0.3997

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1477.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1587.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1624.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_019593.5 NCBI
AAACCGGUUUGAGCGUGGCUGCUUCCUGCCGCUCGACGCCGCGGCAGGC… 5434 nt 0.3997
Summary

Predicted to enable glycerophosphocholine phosphodiesterase activity. Predicted to be involved in glycerophospholipid catabolic process. Predicted to act upstream of or within skeletal muscle tissue development. Predicted to be located in cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in pigs demonstrated that the GPCPD1 was commonly regulated in the skeletal muscle of both cold-exposed Tibetan and Bama pig breeds, indicating its involvement in the transcriptional response to short-term cold stress [Yang et al. DOI:10.3390/ijms24087431].