Basic Information

Symbol
GPD1
RNA class
mRNA
Alias
Glycerol-3-Phosphate Dehydrogenase 1 Glycerol-3-Phosphate Dehydrogenase [NAD(+)], Cytoplasmic Glycerol-3-Phosphate Dehydrogenase 1 (Soluble) EC 1.1.1.8 GPDH-C GPD-C Glycerol-3-Phosphate Dehydrogenase [NAD+], Cytoplasmic Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Glycerophosphate Dehydrogenase EC 1.1.1 HTGTI
Location (GRCh38)
12:50103982-50111316
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005276.4
Sequence length
2887.0 nt
GC content
0.5667

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1181.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1232.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 760.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001257199.2 NCBI
AGGGAGUGUGGCACUGAGCCGGCUCAGGCAGAGACGCGGCACCAUGGCU… 2818 nt 0.5664
NM_005276.4 NCBI
AGGGAGUGUGGCACUGAGCCGGCUCAGGCAGAGACGCGGCACCAUGGCU… 2887 nt 0.5667
Summary

This gene encodes a member of the NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase family. The encoded protein plays a critical role in carbohydrate and lipid metabolism by catalyzing the reversible conversion of dihydroxyacetone phosphate (DHAP) and reduced nicotine adenine dinucleotide (NADH) to glycerol-3-phosphate (G3P) and NAD+. The encoded cytosolic protein and mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase also form a glycerol phosphate shuttle that facilitates the transfer of reducing equivalents from the cytosol to mitochondria. Mutations in this gene are a cause of transient infantile hypertriglyceridemia. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2012]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the GPD1 was significantly altered in expression on day 7 following a 20% total body surface area burn injury, as part of a comprehensive gene expression profiling analysis of liver tissue [Jayaraman et al. DOI:10.1016/j.jss.2007.05.025].