Basic Information

Symbol
ALDOC
RNA class
mRNA
Alias
Aldolase, Fructose-Bisphosphate C Aldolase C, Fructose-Bisphosphate Fructose-Bisphosphate Aldolase C Brain-Type Aldolase EC 4.1.2.13 ALDC Fructose-1,6-Biphosphate Triosephosphate Lyase Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Fructoaldolase C Aldolase 3
Location (GRCh38)
17:28573115-28576948
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from CNS diseases Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005165.3
Sequence length
1608.0 nt
GC content
0.5547

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-595.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -621.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 446.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005165.3 NCBI
AUUUACCAGAGGGAGCCAGGGCUGCAGCCUCAUCUGUUUGCGGAUCAGA… 1608 nt 0.5547
Summary

This gene encodes a member of the class I fructose-biphosphate aldolase gene family. Expressed specifically in the hippocampus and Purkinje cells of the brain, the encoded protein is a glycolytic enzyme that catalyzes the reversible aldol cleavage of fructose-1,6-biphosphate and fructose 1-phosphate to dihydroxyacetone phosphate and either glyceraldehyde-3-phosphate or glyceraldehyde, respectively. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the ALDOC mRNA was up-regulated by 34% in pericontusional brain tissue from a patient with cerebral infarction (I5) following traumatic brain injury, as identified through cDNA microarray analysis [Michael et al. DOI:10.1016/j.jocn.2004.11.003].