Basic Information

Symbol
GPI
RNA class
mRNA
Alias
Glucose-6-Phosphate Isomerase AMF NLK Autocrine Motility Factor Phosphoglucose Isomerase Phosphohexose Isomerase Neuroleukin EC 5.3.1.9 SA-36 PGI PHI Hexose Monophosphate Isomerase Glucose Phosphate Isomerase Hexosephosphate Isomerase Phosphosaccharomutase Phosphohexomutase Sperm Antigen-36 Sperm Antigen 36 Oxoisomerase CNSHA4 GNPI SA36
Location (GRCh38)
19:34359480-34402413
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000175.5
Sequence length
4125.0 nt
GC content
0.5312

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1453.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1528.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 978.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000175.5 NCBI
GCUUGCUGCGCGCUGCCGGCGCUCCUUCCUCCUCGGCUCGCGUCUCACU… 4125 nt 0.5312
NM_001184722.1 NCBI
AAUAGCCCUUACCACCAGCAGACACACAUCAUCUGUUGUACUUGCUUAU… 4275 nt 0.5273
NM_001289789.1 NCBI
AAUAGCCCUUACCACCAGCAGACACACAUCAUCUGUUGUACUUGCUUAU… 4356 nt 0.5292
NM_001289790.3 NCBI
GCUUGCUGCGCGCUGCCGGCGCUCCUUCCUCCUCGGCUCGCGUCUCACU… 4041 nt 0.5296
NM_001329909.1 NCBI
AGAGGCCAGCAAAGCGGCGGCGCAAGAGGUAGGGAGAGAGGAGCUGAGG… 4178 nt 0.5314
NM_001329910.1 NCBI
AGAGGCCAGCAAAGCGGCGGCGCAAGAGGUAGGGAGAGAGGAGCUGAGG… 4153 nt 0.5297
NM_001329911.2 NCBI
GCUUGCUGCGCGCUGCCGGCGCUCCUUCCUCCUCGGCUCGCGUCUCACU… 4098 nt 0.5307
Summary

This gene encodes a member of the glucose phosphate isomerase protein family. The encoded protein has been identified as a moonlighting protein based on its ability to perform mechanistically distinct functions. In the cytoplasm, the gene product functions as a glycolytic enzyme (glucose-6-phosphate isomerase) that interconverts glucose-6-phosphate and fructose-6-phosphate. Extracellularly, the encoded protein (also referred to as neuroleukin) functions as a neurotrophic factor that promotes survival of skeletal motor neurons and sensory neurons, and as a lymphokine that induces immunoglobulin secretion. The encoded protein is also referred to as autocrine motility factor based on an additional function as a tumor-secreted cytokine and angiogenic factor. Defects in this gene are the cause of nonspherocytic hemolytic anemia and a severe enzyme deficiency can be associated with hydrops fetalis, immediate neonatal death and neurological impairment. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2016]

Forensic Context

A study in C. elegans demonstrated that the Nemo-like kinase LIT-1 is a direct target gene of the DAF-12 nuclear receptor, with its expression being regulated in a tissue-specific and stage-specific manner during larval development [Shostak et al. DOI:10.1101/gad.1218504].