Basic Information

Symbol
GPLD1
RNA class
mRNA
Alias
Glycosylphosphatidylinositol Specific Phospholipase D1 Phosphatidylinositol-Glycan-Specific Phospholipase D GPI-Specific Phospholipase D Glycoprotein Phospholipase D EC 3.1.4.50 PI-G PLD PIGPLD1 GPI-PLD Glycosyl-Phosphatidylinositol-Specific Phospholipase D GPIPLDM GPIPLD PIGPLD PLD
Location (GRCh38)
6:24424565-24495205
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001503.4
Sequence length
5790.0 nt
GC content
0.4477

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1852.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1958.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1089.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001503.4 NCBI
GAGUCCCAGUGCUGCUGCAGCUCUGAGCAUUCCCACGUCACCAGAGAAG… 5790 nt 0.4477
Summary

Many proteins are tethered to the extracellular face of eukaryotic plasma membranes by a glycosylphosphatidylinositol (GPI) anchor. The GPI-anchor is a glycolipid found on many blood cells. The protein encoded by this gene is a GPI degrading enzyme. Glycosylphosphatidylinositol specific phospholipase D1 hydrolyzes the inositol phosphate linkage in proteins anchored by phosphatidylinositol glycans, thereby releasing the attached protein from the plasma membrane. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human blood plasma demonstrated that the GPLD1 (phosphatidylinositol-glycan-specific phospholipase D) was upregulated with age and was part of a set of 21 proteins used to build age-predictive models [Salignon et al. DOI:10.18632/aging.204787]. The protein-based model achieved an R² of 0.59 ± 0.02, and combining this proteomic data with miRNA data significantly improved prediction accuracy to an R² of 0.70 ± 0.01.