Basic Information

Symbol
ALG14
RNA class
mRNA
Alias
ALG14 UDP-N-Acetylglucosaminyltransferase Subunit UDP-N-Acetylglucosamine Transferase Subunit ALG14 MGC19780 Asparagine-Linked Glycosylation 14 Homolog (S. Cerevisiae) UDP-N-Acetylglucosamine Transferase Subunit ALG14 Homolog Asparagine-Linked Glycosylation 14 Homolog (Yeast) Asparagine-Linked Glycosylation 14 Homolog IDDEBF CMS15 MEPCA
Location (GRCh38)
1:94974405-95072951
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_144988.4
Sequence length
9375.0 nt
GC content
0.4197

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3361.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3527.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2184.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001305242.2 NCBI
AACUUUGACAGCGGCUGGUCCCCGGAAGUUGGACGCAUGCGCCGUUUCU… 9412 nt 0.4195
NM_144988.4 NCBI
AACUUUGACAGCGGCUGGUCCCCGGAAGUUGGACGCAUGCGCCGUUUCU… 9375 nt 0.4197
Summary

This gene is a member of the glycosyltransferase 1 family. The encoded protein and ALG13 are thought to be subunits of UDP-GlcNAc transferase, which catalyzes the first two committed steps in endoplasmic reticulum N-linked glycosylation. Mutations in this gene have been linked to congenital myasthenic syndrome (CMSWTA). Alternatively spliced transcript variants have been identified. [provided by RefSeq, Mar 2015]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the ALG14 gene was downregulated in subcutaneous adipose tissue during short-term weight loss in obese participants [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].