Basic Information

Symbol
GPR55
RNA class
mRNA
Alias
G Protein-Coupled Receptor 55 G-Protein Coupled Receptor 55 LPIR1
Location (GRCh38)
2:230907318-230961066
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden unexpected death diagnosis Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005683.4
Sequence length
3844.0 nt
GC content
0.5512

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1493.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1565.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 957.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005683.4 NCBI
AGAACAGGCUGACAGCCAGGCCUGGAGGAGAAAUGACAUCUCUCAGCCC… 3844 nt 0.5512
Summary

This gene belongs to the G-protein-coupled receptor superfamily. The encoded integral membrane protein is a likely cannabinoid receptor. It may be involved in several physiological and pathological processes by activating a variety of signal transduction pathways. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

A systematic review of postmortem human brain studies found that the GPR55 mRNA was decreased in the dorsolateral prefrontal cortex of individuals who died by suicide compared to controls, while its protein level was unchanged in the same region [Yamamoto et al. DOI:10.3390/Ijms25115750].