Basic Information
Symbol
GPR6
RNA class
mRNA
Alias
G Protein-Coupled Receptor 6
Sphingosine 1-Phosphate Receptor GPR6
G-Protein Coupled Receptor 6
Location (GRCh38)
6:109978256-109980720
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
MANE select
Transcript ID
NM_005284.5
Sequence length
1783.0 nt
GC content
0.5928
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-735.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-764.44 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
571.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| ACUCGCGGAGCCGGCACAGCGACAGGCGCCCCGCGCUUGCCUCCUCCCC… | 1892 nt | 0.5978 | |
| ACUCGCGGAGCCGGCACAGCGACAGGCGCCCCGCGCUUGCCUCCUCCCC… | 1783 nt | 0.5928 |
Summary
Predicted to enable sphingosine-1-phosphate receptor activity. Predicted to be involved in adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway and regulation of metabolic process. Predicted to act upstream of or within positive regulation of cytosolic calcium ion concentration. Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in cytoplasm and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]
Forensic Context
A study in Wistar-albino rats demonstrated that the GPR6 gene, identified as part of a response to brain injury network, was down-regulated at 12 hours post-mild traumatic brain injury and subsequently up-regulated at 48 hours [Colak et al. DOI:10.1016/j.injury.2012.01.021].