Basic Information

Symbol
GPR68
RNA class
mRNA
Alias
G Protein-Coupled Receptor 68 OGR1 G-Protein Coupled Receptor 12A G-Protein Coupled Receptor 68 GPR12A Ovarian Cancer G Protein-Coupled Receptor, 1 Ovarian Cancer G-Protein Coupled Receptor 1 Sphingosylphosphorylcholine Receptor AI2A6 OGR-1
Location (GRCh38)
14:91232532-91254026
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001177676.2
Sequence length
3056.0 nt
GC content
0.5991

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1340.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1389.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 610.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001177676.2 NCBI
AGGCUGCGGGAAGUCGCUGGAGGGAGAGCUGGGAUCGUGGCUGCAAGGG… 3056 nt 0.5991
NM_001348437.1 NCBI
UGCCCGACGUGGGUGGGGGGGGCGUGGAAUCGGAGCACAACUUGGCCCU… 3021 nt 0.6097
NM_003485.3 NCBI
UGCCCGACGUGGGUGGGGGGGGCGUGGAAUCGGAGCACAACUUGGCCCU… 2834 nt 0.6094
Summary

The protein encoded by this gene is a G protein-coupled receptor for sphingosylphosphorylcholine. The encoded protein is a proton-sensing receptor, inactive at pH 7.8 but active at pH 6.8. Mutations in this gene are a cause of amelogenesis imperfecta. [provided by RefSeq, Feb 2017]

Forensic Context

A study in Wistar-albino rats demonstrated that the GPR68 gene, identified as part of the brain's response to injury, was up-regulated at 1 hour post-mild traumatic brain injury and subsequently down-regulated at 12 hours [Colak et al. DOI:10.1016/j.injury.2012.01.021].