Basic Information

Symbol
GPR88
RNA class
mRNA
Alias
G Protein-Coupled Receptor 88 Striatum-Specific G-Protein Coupled Receptor STRG Probable G-Protein Coupled Receptor 88 G-Protein Coupled Receptor 88 G Protein Coupled Receptor 88 COCPMR
Location (GRCh38)
1:100538139-100542021
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022049.3
Sequence length
3492.0 nt
GC content
0.5221

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1251.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1315.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 864.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_022049.3 NCBI
GUUCACCACAUCAGCCACCACUCCUGCUUCUGAGCACAGGGUGCUCUCC… 3492 nt 0.5221
Summary

The protein encoded by this gene is a G protein-coupled receptor found almost exclusively in the striatum, a brain structure that controls motor function and cognition. Defects in this gene have been associated with chorea, speech delay, and learning difficulties, as well as some neuropsychiatric disorders. [provided by RefSeq, Mar 2017]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that binge-like ethanol consumption via a drinking-in-the-dark paradigm altered the expression of the GPR88 in the prefrontal cortex, as identified by RNA-seq analysis, and subsequent qPCR validation confirmed its downregulation following treatment with the PARP inhibitor ABT-888 [Vallerini et al. DOI:10.1016/J.Neuroscience.2020.09.010].