Basic Information

Symbol
GPRC5C
RNA class
mRNA
Alias
G Protein-Coupled Receptor Class C Group 5 Member C RAIG-3 G-Protein Coupled Receptor Family C Group 5 Member C Retinoic Acid-Induced Gene 3 Protein RAIG3 G Protein-Coupled Receptor, Family C, Group 5, Member C G Protein-Coupled Receptor, Class C, Group 5, Member C Retinoic Acid Responsive Gene Protein Orphan G-Protein Coupled Receptor
Location (GRCh38)
17:74424851-74451653
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022036.4
Sequence length
1813.0 nt
GC content
0.6145

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-782.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -814.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 427.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001366261.2 NCBI
AGAAACUCCCAUCUCCCUCACCAGCCGGAAAGUACGAGUCGGCUCAGCC… 4088 nt 0.6040
NM_001366262.2 NCBI
AGAAACUCCCAUCUCCCUCACCAGCCGGAAAGUACGAGUCGGCUCAGCC… 2195 nt 0.6378
NM_018653.5 NCBI
GGGGAACCUCCCUGAAGAGUGCCCUGGUCACAGCACCCUUGAAGACAGC… 1820 nt 0.6148
NM_022036.4 NCBI
AGAAACUCCCAUCUCCCUCACCAGCCGGAAAGUACGAGUCGGCUCAGCC… 1813 nt 0.6145
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the type 3 G protein-coupled receptor family. Members of this superfamily are characterized by a signature 7-transmembrane domain motif. The specific function of this protein is unknown; however, this protein may mediate the cellular effects of retinoic acid on the G protein signal transduction cascade. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A review of human multi-omics studies for biological age estimation, which synthesizes findings from various cited works, identifies the GPRC5C as a proteomic aging biomarker with higher abundance in the age-dependent urine proteome of healthy men [Solovev et al. DOI:10.1016/j.mad.2019.111192].