Basic Information

Symbol
GPS1
RNA class
mRNA
Alias
G Protein Pathway Suppressor 1 COPS1 CSN1 JAB1-Containing Signalosome Subunit 1 COP9 Signalosome Complex Subunit 1 SGN1 COP9 Signalosome Subunit 1 Signalosome Subunit 1 Protein MFH GPS-1
Location (GRCh38)
17:82050691-82058057
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001321092.3
Sequence length
1841.0 nt
GC content
0.6165

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-757.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -787.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 396.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001321089.3 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 2057 nt 0.6193
NM_001321090.3 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 2045 nt 0.6196
NM_001321091.3 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 2042 nt 0.6195
NM_001321092.3 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1841 nt 0.6165
NM_001321093.3 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1926 nt 0.6194
NM_001330539.3 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1838 nt 0.6164
NM_001330541.3 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1850 nt 0.6162
NM_001394759.1 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 2054 nt 0.6193
NM_001394760.1 NCBI
GUGGGGCUCGCCGUCGGGGUCGGGGUCCGGCGCACCUGCUGGCGGGCCC… 2050 nt 0.6234
NM_001394761.1 NCBI
GUGGGGCUCGCCGUCGGGGUCGGGGUCCGGCGCACCUGCUGGCGGGCCC… 2035 nt 0.6236
Showing 1 to 10 of 28 entries
Summary

This gene is known to suppress G-protein and mitogen-activated signal transduction in mammalian cells. The encoded protein shares significant similarity with Arabidopsis FUS6, which is a regulator of light-mediated signal transduction in plant cells. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GPS1 shows a decrease in abundance in skeletal muscle during the early post-mortem interval, establishing its utility as a proteomic marker for PMI estimation [Alex et al. DOI:10.1016/j.scijus.2025.101320].