Basic Information

Symbol
GPS1
RNA class
mRNA
Alias
G Protein Pathway Suppressor 1 COPS1 CSN1 JAB1-Containing Signalosome Subunit 1 COP9 Signalosome Complex Subunit 1 SGN1 COP9 Signalosome Subunit 1 Signalosome Subunit 1 Protein MFH GPS-1
Location (GRCh38)
17:82050691-82058057
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001321092.3
Sequence length
1841.0 nt
GC content
0.6165

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-757.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -787.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 396.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001394762.1 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1881 nt 0.6178
NM_001394763.1 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1966 nt 0.6205
NM_001394764.1 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1878 nt 0.6177
NM_001394765.1 NCBI
UGGUGCCACCGAGGCUGAAGCAGGCGGCCAUCGGUUGGGAUCUCUUGAG… 1946 nt 0.6187
NM_001394766.1 NCBI
GUGGGGCUCGCCGUCGGGGUCGGGGUCCGGCGCACCUGCUGGCGGGCCC… 1846 nt 0.6208
NM_001394767.1 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1938 nt 0.6192
NM_001394768.1 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1935 nt 0.6191
NM_001394769.1 NCBI
UGGUGCCACCGAGGCUGAAGCAGGCGGCCAUCGGUUGGGAUCUCUUGAG… 1934 nt 0.6189
NM_001394770.1 NCBI
GUGGGGCUCGCCGUCGGGGUCGGGGUCCGGCGCACCUGCUGGCGGGCCC… 1919 nt 0.6238
NM_001394771.1 NCBI
GUGGGGCUCGCCGUCGGGGUCGGGGUCCGGCGCACCUGCUGGCGGGCCC… 1834 nt 0.6210
Showing 11 to 20 of 28 entries
Summary

This gene is known to suppress G-protein and mitogen-activated signal transduction in mammalian cells. The encoded protein shares significant similarity with Arabidopsis FUS6, which is a regulator of light-mediated signal transduction in plant cells. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GPS1 shows a decrease in abundance in skeletal muscle during the early post-mortem interval, establishing its utility as a proteomic marker for PMI estimation [Alex et al. DOI:10.1016/j.scijus.2025.101320].