Basic Information

Symbol
GPS1
RNA class
mRNA
Alias
G Protein Pathway Suppressor 1 COPS1 CSN1 JAB1-Containing Signalosome Subunit 1 COP9 Signalosome Complex Subunit 1 SGN1 COP9 Signalosome Subunit 1 Signalosome Subunit 1 Protein MFH GPS-1
Location (GRCh38)
17:82050691-82058057
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001321092.3
Sequence length
1841.0 nt
GC content
0.6165

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-757.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -787.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 396.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001394772.1 NCBI
GUGGGGCUCGCCGUCGGGGUCGGGGUCCGGCGCACCUGCUGGCGGGCCC… 1831 nt 0.6210
NM_001394773.1 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1923 nt 0.6193
NM_001394774.1 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1772 nt 0.6174
NM_001394775.1 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1760 nt 0.6176
NM_001394776.1 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1885 nt 0.6218
NM_001394777.1 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1718 nt 0.6176
NM_004127.7 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 1853 nt 0.6163
NM_212492.4 NCBI
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUU… 2336 nt 0.6430
Showing 21 to 28 of 28 entries
Summary

This gene is known to suppress G-protein and mitogen-activated signal transduction in mammalian cells. The encoded protein shares significant similarity with Arabidopsis FUS6, which is a regulator of light-mediated signal transduction in plant cells. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GPS1 shows a decrease in abundance in skeletal muscle during the early post-mortem interval, establishing its utility as a proteomic marker for PMI estimation [Alex et al. DOI:10.1016/j.scijus.2025.101320].