Basic Information

Symbol
GPS2
RNA class
mRNA
Alias
G Protein Pathway Suppressor 2 GPS-2 AMF-1
Location (GRCh38)
17:7311324-7315564
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004489.5
Sequence length
1176.0 nt
GC content
0.5723

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-406.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -428.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 257.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004489.5 NCBI
GGAGCCGCUGAGAAAGCGCAGAGAAGGCGGGCCCCGUCUGAGGUCUGGC… 1176 nt 0.5723
Summary

This gene encodes a protein involved in G protein-mitogen-activated protein kinase (MAPK) signaling cascades. When overexpressed in mammalian cells, this gene could potently suppress a RAS- and MAPK-mediated signal and interfere with JNK activity, suggesting that the function of this gene may be signal repression. The encoded protein is an integral subunit of the NCOR1-HDAC3 (nuclear receptor corepressor 1-histone deacetylase 3) complex, and it was shown that the complex inhibits JNK activation through this subunit and thus could potentially provide an alternative mechanism for hormone-mediated antagonism of AP1 (activator protein 1) function. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.