Basic Information
Symbol
ALKAL2
RNA class
mRNA
Alias
ALK And LTK Ligand 2
FAM150B
AUGA
Family With Sequence Similarity 150 Member B
Augmentor Alpha
AUG-Alpha
Family With Sequence Similarity 150, Member B
Augmentor-Alpha
Protein FAM150B
Augmentor-Beta
PRO1097
RGPG542
Location (GRCh38)
2:278286-289623
Forensic tag(s)
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_001002919.3
Sequence length
1184.0 nt
GC content
0.4949
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-417.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-439.09 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
228.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUGGGCGGGACCUCGGGCGUGAUCGUCGAGGAGACCGCGGCUCCCUCAC… | 1184 nt | 0.4949 |
Summary
Enables protein tyrosine kinase activator activity and signaling receptor binding activity. Involved in cell surface receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; positive regulation of MAPK cascade; and positive regulation of neuron projection development. Is active in extracellular space. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]
Forensic Context
A study in rats demonstrated that ultraviolet-B (UVB)-induced inflammation led to transcriptional changes in the L4 and L5 dorsal root ganglia (DRG), where the ALKAL2 was significantly up-regulated with a fold change of 6.8 [Dawes et al. DOI:10.1371/journal.pone.0093338].