Basic Information
Symbol
GRB2
RNA class
mRNA
Alias
Growth Factor Receptor Bound Protein 2
Growth Factor Receptor-Bound Protein 2
NCKAP2
SH2/SH3 Adapter GRB2
Protein Ash
ASH
Epidermal Growth Factor Receptor-Binding Protein GRB2
Epididymis Secretory Sperm Binding Protein
Growth Factor Receptor-Bound Protein 3
Abundant SRC Homology
Adapter Protein GRB2
EGFRBP-GRB2
MSTP084
Grb3-3
MST084
HT027
Location (GRCh38)
17:75318076-75405709
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
Wound age identification
Mechanical injury analysis
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_002086.5
Sequence length
3273.0 nt
GC content
0.5185
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1200.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1259.01 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
735.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGCCAGGAGGUAUUGCUGCUUCGGCGACCGGGCGGCGGCAGCGGCGGCG… | 3273 nt | 0.5185 | |
| AGCCAGGAGGUAUUGCUGCUUCGGCGACCGGGCGGCGGCAGCGGCGGCG… | 3150 nt | 0.5181 |
Summary
The protein encoded by this gene binds the epidermal growth factor receptor and contains one SH2 domain and two SH3 domains. Its two SH3 domains direct complex formation with proline-rich regions of other proteins, and its SH2 domain binds tyrosine phosphorylated sequences. This gene is similar to the Sem5 gene of C.elegans, which is involved in the signal transduction pathway. Two alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in humans demonstrated that the GRB2 was more highly expressed in sepsis survivors compared to non-survivors and its expression was also elevated in subjects with VPS9D1 missense variants, which were associated with sepsis survival [Tsalik et al. DOI:10.1186/s13073-014-0111-5]. In a porcine model of cutaneous bromine injury, the GRB2 was identified as a significantly increased transcript at 7 days post-exposure, implicating its role in acute phase response and growth factor signaling pathways during wound healing [Price et al. DOI:10.1016/j.toxlet.2008.08.007]. A study in humans demonstrated that the GRB2 was up-regulated by 18% in pericontusional brain tissue from a traumatic brain injury patient [Michael et al. DOI:10.1016/j.jocn.2004.11.003]. In a separate study investigating UVB-induced inflammation in human and rat skin, the GRB2 was identified as a direct interactor of the highly up-regulated protein SH2D5, which is involved in intracellular signal transduction in receptor tyrosine kinase pathways [Dawes et al. DOI:10.1371/journal.pone.0093338].