Basic Information

Symbol
GREM1
RNA class
mRNA
Alias
Gremlin 1, DAN Family BMP Antagonist DAND2 DRM Cysteine Knot Superfamily 1, BMP Antagonist 1 CKTSF1B1 Gremlin HMPS Down-Regulated In Mos-Transformed Cells Protein Cell Proliferation-Inducing Gene 2 Protein Hereditary Mixed Polyposis Syndrome Colorectal Adenoma And Carcinoma 1 DAN Domain Family Member 2 Gremlin-1 CRAC1 IHG-2 Gremlin 1, Cysteine Knot Superfamily, Homolog (Xenopus Laevis) Gremlin 1, Cysteine Knot Superfamily, Homolog Down-Regulated In Mos-Transformed Cells Increased In High Glucose Protein 2 Increased In High Glucose-2 Gremlin 1-Like Protein Gremlin 1 C15DUPq DUP15q CRCS4 HMPS1 MPSH PIG2
Location (GRCh38)
15:32716998-32745106
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_013372.7
Sequence length
14575.0 nt
GC content
0.3977

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4168.87 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4455.93 kcal/mol
Frequency: 5.29186e-203
Diversity: 3300.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001191322.2 NCBI
ACUCGGUGCGCCUUCCGCGGACCGGGCGACCCAGUGCACGGCCGCCGCG… 3924 nt 0.4243
NM_001191323.2 NCBI
ACUCGGUGCGCCUUCCGCGGACCGGGCGACCCAGUGCACGGCCGCCGCG… 4011 nt 0.4288
NM_001368719.1 NCBI
AGACGCGCCCGCUUAGCGAGGGCGCGAAGUCCAGGCCGCCAGAGCGCAG… 14636 nt 0.3978
NM_013372.7 NCBI
ACUCGGUGCGCCUUCCGCGGACCGGGCGACCCAGUGCACGGCCGCCGCG… 14575 nt 0.3977
Summary

This gene encodes a member of the BMP (bone morphogenic protein) antagonist family. Like BMPs, BMP antagonists contain cystine knots and typically form homo- and heterodimers. The CAN (cerberus and dan) subfamily of BMP antagonists, to which this gene belongs, is characterized by a C-terminal cystine knot with an eight-membered ring. The antagonistic effect of the secreted glycosylated protein encoded by this gene is likely due to its direct binding to BMP proteins. As an antagonist of BMP, this gene may play a role in regulating organogenesis, body patterning, and tissue differentiation. In mouse, this protein has been shown to relay the sonic hedgehog (SHH) signal from the polarizing region to the apical ectodermal ridge during limb bud outgrowth. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2010]

Forensic Context

A study in human and rat corpus cavernosum identified the GREM1 as a secreted protein whose expression was not correlated with PI16+ or APO+ fibroblast niche scores but was significantly positively correlated with the COMP+ fibroblast niche score [Yin et al. DOI:10.1016/j.celrep.2024.114760].