Basic Information

Symbol
GRIA2
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Ionotropic Receptor AMPA Type Subunit 2 GluR-K2 GluR-B GluR-2 GluA2 Glutamate Receptor 2 GLURB GLUR2 Glutamate Receptor, Ionotropic, AMPA 2 AMPA-Selective Glutamate Receptor 2 AMPA Receptor Subunit GluA2 Glutamate Receptor Ionotropic, AMPA 2 NEDLIB HBGR2
Location (GRCh38)
4:157204182-157387146
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Forensic psychiatry-related diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001083619.3
Sequence length
5611.0 nt
GC content
0.3791

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1457.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1569.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1607.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000826.6 NCBI
GAGUGUGUGUGAGUGCAUGGGAGGGUGCUGAAUAUUCCGAGACACUGGG… 5611 nt 0.3784
NM_001083619.3 NCBI
GAGUGUGUGUGAGUGCAUGGGAGGGUGCUGAAUAUUCCGAGACACUGGG… 5611 nt 0.3791
NM_001083620.3 NCBI
CUCUGUGACUUGCCUGUGUGUGUGCGUGUGUGUAUGUGUGUGUGUGUGU… 5315 nt 0.3750
NM_001379000.3 NCBI
GCUUGUUUGCUUUCGGCUGGGUCAGGGGGGCUAUUUCCUAGGGGCGCCG… 5233 nt 0.3723
NM_001379001.3 NCBI
AGCAUCUCCGCAGCAGCUGCAACAGCCGCACGAAGGGGGGCUAUUUCCU… 5243 nt 0.3723
Summary

Glutamate receptor s are the predominant excitatory neurotransmitter receptor s in the mammalian brain and are activated in a variety of normal neurophysiologic processes. This gene product belongs to a family of glutamate receptor s that are sensitive to alpha-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole propionate ( AMPA ), and function as ligand-activated cation channels. These channels are assembled from 4 related subunit s, GRIA1-4. The subunit encoded by this gene (GRIA2) is subject to RNA editing (CAG->CGG; Q->R) within the second transmembrane domain, which is thought to render the channel impermeable to Ca(2+). Human and animal studies suggest that pre-mRNA editing is essential for brain function, and defective GRIA2 RNA editing at the Q/R site may be relevant to amyotrophic lateral sclerosis (ALS) etiology. Alternative splicing, resulting in transcript variants encoding different isoforms, (including the flip and flop isoforms that vary in their signal transduction properties), has been noted for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GRIA2 is a protein-coding gene identified as a differential wiring (DW) gene in the prefrontal cortex, enriched in synapse part annotation, and is also part of a common cosplicing network of glutamatergic synapse genes [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155]. A review of human and rodent studies reported that miR-181a directly and negatively regulates the expression of the human glutamate receptor gene GRIA2 in the plasma of patients with methamphetamine use disorder [Gu et al. DOI:10.1007/s11010-021-04160-y]. A study in humans demonstrated that the GRIA2 was down-regulated in post-mortem brain tissues from individuals with chronic traumatic encephalopathy (CTE), CTE with Alzheimer's disease (CTE/AD), and Alzheimer's disease (AD) compared to normal subjects, as identified through transcriptome sequencing and differential expression analysis [Cho et al. DOI:10.1038/s41598-020-65916-y].