Basic Information

Symbol
GRID1
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Ionotropic Receptor Delta Type Subunit 1 GluD1 KIAA1220 Glutamate Receptor Ionotropic, Delta-1 GluR Delta-1 Subunit Glutamate Receptor, Ionotropic, Delta 1 Glutamate Receptor Delta-1 Subunit GluD1-B
Location (GRCh38)
10:85599552-86366795
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017551.3
Sequence length
6154.0 nt
GC content
0.5457

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2369.12 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2473.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1676.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((.(..(((.((.((.(((((((((..(((.(((...((((......)))).((((....))))(((((((((((.(((((((((.....(((...((.((((......)))).))...)))((((..((((((((((((((((.((((.((((((.((..(((((.(((((.((((.((....((...(((.((....))))).))))))))))).))))))))))))))).)))).)))))..))))..))))))).))))))))))).......(((((((((..((((((((((((..(((....((((((((((((((..((((((...........))))))..)))))(((((.....((((((((((((((((((.(((((((((((((....(((((((.......)).))))))))))))(((((((....))))))))))))))))........)))))))).)))).))).....)))))(((.((((((((.(((((.(((((((((...(((((.(((.((......))))))))))...)))))))))..((..(((.((.....)).)))..))..((((((.((((............((((((((........)))))).))))))))))))(((((........)))))....)))))..))))))))..)))((....))..)))))))))....(((((.......))))).(((......)))....)))..))))))))))))))).))).)))....(((((((((((((.(((((.(((((((((((........))))))).(((.....))).(((.((..((((((((((((..((((((((((((.((((....))))...)))))))).........))))))))))))))))..)))))......(((((((...((((((((((.((((((......((((..((........((((........))))))..)))).....))))))((((((......))))))....((.(((((...((...(((((..(((......)))...)))))..)))))))))..((((((....))))))......))))))).)))((((((((((.((((((.(((((((((.(((((((.(((.............))).)))))))(((((...))))).((((....(((...(((((((((..(((.....)))...)))))))))...)))..)))).....((.((((....((.....))...)))).)).(((((((...((.((((((((((((((.......((((((((....(((((........((((((((.(((((((((.((((((((((...((((((.(((....)))))))...))...)))).)))))).).))))....))))))))))))...((((((..(....)..))))))..((((((((.....((((........((((((((.(.((..((((.((((((((((((.((((((((.(((((.............)))))..))))))))......(((((....))))).........(((......)))((((((((.((....(((.(((......))))))...)).))))))))..((((((((((.((((((.((((.(.((((......))))...).)))).)))))))))....)))))))....(((((((.((((.(((((.((((((((((............))))..........)))))))))))...((((((((((((((((((((((((.....)))))..))))))((((((((.....((((((((.(.((((..........)))).).)).))))))....)).))))))....)))))...)))))))))))).))))))))))))))))))).))))...)).).))))).)))........))))))))))))......(.(((.((((.....)))).))).))))))....))))))))(((((.((((((((............((((((((((....((.((((.(((((((....))))))).)))).)).....((((((......))))))(((((.(..(((.......)))..))))))..(((((((((((((((.(((..(((.((..((((..((((..((.(((((((..(((((.((......)))))))..))))))).))))))))))..)).)))..))).)))).)))))))))))...(((((.....))))).....))))))))))....((((.(((((((....(((.((((....((((((...(((((((.(((((((((((....))).......)))))).)))))))))...)))))))))).)))..((((....)))).((((..(((.(((........))))))..).))).....((((((((((....(((....)))))))))..))))((((((((((((......))).))))))))).))))))).))))..)))))))).))))).....))))))))).)))..)).)).)))).)))...((.((((((....((((.(...(((.((((((...)))))))))...))))).......)))))).)).((((((((((((((((((((((((...(((((.(((((......))))).)))))((((((..((((..(((((((...((.((((((.(((((((((((.(((.((((((((((.((((((....)).))))...(((((.(..((((((((.((......))..(((((....))))).(((((((((....).))))))))..))))))))..))))))((.(((((((((.(((..((.(((((......)))))..))))))))))))))))........((((((((..(((((...(((((((((((((...((...(((((......)))))..))..))).)))))).))))...))))).((((.(((((........))))).)))).((((((((..((((((((............))))))(((.(((((((.............))))))))))..((((.(((((((.(((((..(((((...(((....)))((...((((....)))).)).((((....)))).)))))(((((((...))))))).....(((((((.....((((........).))).....)))))))))))).)))))))...)))).)).))))))))....))))))))..)))))))...(((((.((((.............)))).)))))...(((..(((((((((..(((.((.(((((((((..(((((....................((.(((.......................................)))))......(((((((.(((((((..........)))).)))...)))))))...........((((((.(.(((((......(((((((((((..((.(.((((.((((((((..........................)))))))).))))(((((((.....)))))))(((........)))).))..)))).))))))).......)))))))))))).)))))......))))))))).)).)))..)))))..)))).))).....((((.((((.((((..((.((((...............)))))).)))).)))).)))).))).))))))))))..)))).).))))).)))))))))...))))..)))))).......((((.(((...(((((.....)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))((((..((((((((.(((((((.((((((....))))))...)))((((......))))...(((((((......))).))))((((.....)))).....)))).)))))).))))))....((((((..((((((((((...)).))))))))..))))))((((.((((.....)))))))).........((((.(((((((.((((((..........))))))((((.....)))).......((((((((.(((((.....))).)).))))))))))))))).)))))))))).))))))))))...))))))))))).))))).))).))).).))))))((((.........)))).))))))))))))).....(((.(((((....((((.....))))))))).)))(((((...)))))...((((((.((((.((((((((((....(((((((.(((((((....(((((.(.((((.....((((((.......)))))).(((((((.((((..(((((((((......(((((.....)))))..(((((......((((.....((((...))))....(((((((.(((((.(((((((........)))))))..((((((((..(((((((........))).)))))))))).))............((((((....)))))).......(((.((.((((((........)))))).)).)))............))))).))).....)))).((((((.......))))))..)))).....))))).))).))))...))..))))))))))).((((((............)))))).......(((...(((((((((.......)).))))))).)))...........)))).).))))).....(((.((.(((((((((((..(((((((((((.........)).)))))..)))).........(((((((.((((((((((((..(......)..)).)))))))))).))))))).(((....))).(((((.....)))))..(.((((.(((..........)))..)))).)))))))))))).)).))).....((((((..((..((((....))))..))))))))..(((((((.(((...........)))...)))))))..)))))))..)))))))((((((.(((((((((((((...(((((((........))))(((((((((((((((((....(((......))).(((((..((.((.....)).))..)))))((((((..(((...)))))))))))))))))........................(((((.(((..((((((((((((...(((.(...((((((((.............(((((......((((((((((.(......)))..)))))))).)))))))))))))((((......).)))..).)))...))))))..))))))))))))))((((.(((((...))))).))))))))))))))))...)))))))))))))...........)))))))))))))))).)))).)))))).....((((.(((((((..((((((..(((((.....)))))..))))))...(((((...((((((((((....))))...)))).))...)))))))))))).)))))).).)))..).)))))))).)).)).))).).)))(((((((((((.((.(((((((.((((((((.(((((((...((((((...(((((....((((((..(((((((((.((((((((((..........(((((((........)))))))..(((((((....)))))))(((((((((((((..(((((((.((.(((((......)))))...(((.......))))).)))))))..))))))))))))).............))))).))))).)))..))))))..))))))....)))))...))))))...)))....)))).)))...)).))))))))))...(((((((...))))))).)).)))).))))))).(((.((((.((((...)))))))).)))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{((.,{.(((.((,((.(((((((((..((({((({,.((((......}))){(((((.......(((((((((((,(((((((((..,,.(((.,.((.((((......)))).))...))),||{,,((((((((((((((((.((((.(((((,,((..(((((.(((((.((({,({...{((..{(||.{{.,,.})))).,}))))))))).))))))))))))))).)))).)))))..))))..))))))),),)))))))),.......(((((((((..((((((((((((..(((.,..((((((((((((((..((((((...........))))))..)))))(((((.....((((((((((((((((((.(((((((((((({...,(((((((.......}},})))))))))))(((((((....))))))))))))))))........)))))))).)))).))).....))))){{{.((((((((.(((((.(((((((((...(((((.(((.({......)}))))))))...)))))))))..((..(((.((.....)).)))..))..,{{,(({(((({(({...,,,..((((((((........)))))).))}||,.,},,,,{|||}...}}}})))))))..)))))..))))))))..}}},,....)}..)))))))))....(((((.......))))).,{,......}}}...,)))..))))))))))))))).))).))){{{{({(((({((((((.(((({,(((({((((((,.......|||||}{,(((.....}}},(((.{{..((((((((((((..((((((((((((.((((....))))...)))))))).........)))))))))))))))).,})))),,,.,,|||,,,||{,{{|||||||||(((((({,{.{,,.{{..{{,,....,}}((((..,{.....}}.,}})),}.....}}}}}}((((((......))))))..,.((,(({{{...||,.,|((((..(((......)}}...}}}}}{{|||||||||.,{(({{(((,.,|||{{{,,,..|||||{{{,((((.{({,,,|||{|||..,{||,||||,{{(((((,{{{{,..{......,|))|.}})}}||((({{{{{{||,|{((((,,.(((({,,{((((((((..(((.....))),..)))))))){(((,,...))))....,|,..,||,.{,|{,....||,,,||,},}||{{{({{({{{({,.{{{{(((((((((....,||{(((((((..{,(((((.,{{....((((((((.(((((((((.((((((((((...(({(((.(((....)))}})),..))...)))).)))))).).))))....))))))))))))..{(((,,,..,..}}),.})))})}}||||({{{,|||}{,{{.,......{{{((({,.,.,|,,|||{.((((((((((((.{(((((((.(((((....,........)))))..))))))}},,,...(((((....))))).........(({......)))((((((((.({...,(((.(((......)))))},..}).))))))))..((((((((((.((((((.((((.{.{((({.....})))...}.)))).)))))))))....)))))))....(((((((.((((.(((((.((((((((((............)))),.........)))))))))))...((((((((((((((((((((((((.....)))))..))))))((((((((.....((((((((.{.((((..........)))).}.)).))))))....)).))))))....)))))...)))))))))))).))))))))))))))))))).)))),,,)).).))))).))}}.,}},}.)))))))))))),,}}}},,(((.{(((.....)))}.))),||||||....},,,})})|||||,||{{{{{{,|,.,,|,,,,{(((({((((({{{((,,.,(({((((((.{{...,)),))}),)))))..,..((((((......))))))((((({(((({,{((.{{{{},{{{||}},..((((({({{((((({{,,,{{{(({((.{(((({,({(,,,((.{((((({..||||||||,,.,,))))))},..}}}|||}.,|}|||||||{,||,|||,,|||{.|||{|||,||||}}|,.,||||{.....))))),....|||||},)))|..|{{{{.(((((((,||||{{{((((,...|((||{...((((((((((((((((,,,..,,|,,..,,,..)))))).)))))))))..,}))))}|||}.,|||||,.....})},,,|||{..(({,(((.......,))})))..).))),}}..((((((((((....(((....))))))))),.,)))((((((((((((......))),})))))))).))))))).))))..})),,}||,||}},.....))))))))),))),,)))))})))).)},...||.((((((,.,.{{((.{,.,(((,((((({...})))))))}.,.))))),,,.,,.)))))).}}|({{({((((({{{({{{((((({(...(((((.(((((......))))).)))))|{||||,.{|{{.,||||{{|,,}{,,||||,|,,||||||||||,|||,{{,,,|||||,|||{||,,,,))}})))|..(((((.(..((((((((.((......},..(((((....))))).(((((((((....).))))))))..})))))))..)))))){{.(((((((((.(((..(,.(((((......)))))..),))))))))))))}}....,,,,({{{{((,..{{{||...|||||{|||||||}}}||}|,{{{{{...,,,)))))},}},,))}.}||||}.}})),,.)}})).{{{{.{{{{{.,,...,,))))),}))}.||||||||,.,.||||||,...,,,.....))}||}(((.(((((((.............)))))))))).}|,||.{{{((({.{,||||}|||||,..|||.,,.)))|{...||||},,,,)))},|.(((((...,|||.))))}{((((({...))))))},,,.,(({(({(.,|,.(((,...,,,.|),),),....}||||}||}}}|{||},}}}.,,))}}.}).)))))}}},,,,||}|||||..}||||||...(((((.((((..{{,,..,..,,)))).)))))}}}|||..{(((({(((,,({(,((.{(((((({{,{((((.,,.{{{{.,,{,,,,...,{((,,{{{{{{{{......,}}},.............,,,.,{.{{{{{,,...,,,(((((((,({(((((..........})))}}))...}}))))).........,,{{{{((.(.(((((....,,({(((({({{{..{{.,,{{({.((((((((........,,{.......}}}.....)))))))).})}|(((((((.....)))))))}.{{{,.....|||}.||..}})).})))))}|...,,.}}}})})))))}.))))|,,....})))))|||{||{||,.,|,,,,..)),)})))}}...((((.((((.((((..,(.((((,............,.))))}}.)))).)))).)))).,}),))))}}}}}}...))}.,}))))),))))))))),,.}))),}))))}}......,||||.||,,,,(((((,...,)))))|||{|}}}))))))))})))))}})))))}||||||}||||||||..||||||||,|||{{{(.((((((....))))))...)}}((((,,....}}}}...|||||||......})).}}||{|||.,,,.})))))),,)))),)|||}}.|||}}},|}||,||||,,(((((((({,...,}.)))))))).,||||}(((((.((((.....)))))))))..,,.,,))))}|(((((((((((({((((,......,)))))}.....}))))).})))},.,}}))||,}|{|}}}}}.,,}}.,,((((((....)))))).))))))}))))}))))))}})})),)}))),}))),))))),))).))),),,)))))||||,},.}}})},,,,,))))))))))))).......)))).}}..,.((((.....)))))))))})},(((((...)))))..,((((((.{(((.((((((((((....{((((((.((((((({...(((((.(.((((...,.((((((.......)))))).(((((((.((((..(((((((((.,,.,,(((((,,,..)))}}..(((((......((((..,,.{{{{...}))}.}}}(((((((.(((((.(((((((........)))))))..(({((({,{{(((((((........)))},)))))}))).))............((((({....)))))).......(((.((.((((((........)))))).)).)))............))))).))).....)))).((((((.......))))))..)))).....)))),.))),}))),..,)..))))))))))).{((((,...,,,......,}}}}|,......(((...(((({,{((((......))))))))).)))..}...,,,..)))).).))))).....{((.((,(((((((((((..(((((((((((.........)).)))))..)))).......,.(((((((.((((((((((((..(......)..)).)))))))))).))))))).,.....||},.(((((.....))))),,(.((((.(((..........)))..)))).)))))))))))).)).))}..({{((((((..((..((((....))))..))))))},})|||((((,(({...........))).,.))))})),,))}))))..))))))}((((({.(((((((((((((...(((((((........)))){(((((((({((((((({,.,(({..,{{{|||.(((((..((.((.....)).))..))))),{{{||}.{||,..,),)))})))))))))),.,{,..{{{{,...}}}}}..,,{((({{(((..((((((((((((...{((,{,{{((((((((........,....{{{{{......((((((((((.,,.....,)),.}))))))).)))}}))))))))}|||.....,}.,},.,,,)}}...))))))..)))))))))))))}((((.(((((...))))).))))}))))))),))).,.)))))))))))))...........)))))))))))))))).)))}.)))))).||..((((.(((((((..((((((..(((((.....)))))..))))))...(({{{...(((((({(({..,,|||....)))),})...)))))))))))).))))}).,.)))..).)))))))).)).)),))),).)))(((((((({(({({,({((((({({(({({(,{,({(((,,.((((((...(((((....((((((.,(((((((((.((((((((((..........(((((((........)))))))..{((((((....})))))),(((((((((((((((((,,{,.,..(((((.....}))))},,.{(.,(({...)))).,},,}}})}))))))))))))))}............))))).))))).)))..)))))),.))))))....)))))...))))))...}},....)))).)))...}}.))))))))))...(((((((...))))))).)).)))).))))))}.{({.({{{.,{,.,,,}}},}}}},}},........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_017551.3 NCBI
AGUUCGCUCCUCGCCGGGGCUCAGACACACAGCCAGCCCAGAGCCGCCA… 6154 nt 0.5457
Summary

This gene encodes a subunit of glutamate receptor channels. These channels mediate most of the fast excitatory synaptic transmission in the central nervous system and play key roles in synaptic plasticity.[provided by RefSeq, Jan 2009]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.