Basic Information

Symbol
GRID2
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Ionotropic Receptor Delta Type Subunit 2 GluD2 Glutamate Receptor, Ionotropic, Delta 2 Glutamate Receptor Ionotropic, Delta-2 GluR Delta-2 Subunit GluR-Delta-2 Glutamate Receptor Delta-2 Subunit SCAR18 GLURD2
Location (GRCh38)
4:92303966-93810157
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001510.4
Sequence length
5783.0 nt
GC content
0.4230

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1618.41 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1725.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1573.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001286838.1 NCBI
UGCAAACAACUCUGGCGAUGCCAAAAUUCCCCUCCAAGUGACACGGCUU… 5069 nt 0.4026
NM_001510.4 NCBI
AAACCGGCUCCCCGGGCCCGCCUCGCCAAGCUGCGUUCCGCGCCUCACG… 5783 nt 0.4230
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the family of ionotropic glutamate receptors which are the predominant excitatory neurotransmitter receptors in the mammalian brain. The encoded protein is a multi-pass membrane protein that is expressed selectively in cerebellar Purkinje cells. A point mutation in the mouse ortholog, associated with the phenotype named 'lurcher', in the heterozygous state leads to ataxia resulting from selective, cell-autonomous apoptosis of cerebellar Purkinje cells during postnatal development. Mice homozygous for this mutation die shortly after birth from massive loss of mid- and hindbrain neurons during late embryogenesis. This protein also plays a role in synapse organization between parallel fibers and Purkinje cells. Alternate splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. Mutations in this gene cause cerebellar ataxia in humans. [provided by RefSeq, Apr 2014]

Forensic Context

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