Basic Information

Symbol
GRIN2B
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Ionotropic Receptor NMDA Type Subunit 2B GluN2B NR2B NMDAR2B Glutamate Receptor, Ionotropic, N-Methyl D-Aspartate 2B Glutamate [NMDA] Receptor Subunit Epsilon-2 N-Methyl D-Aspartate Receptor Subtype 2B N-Methyl-D-Aspartate Receptor Subunit 3 Glutamate Receptor Ionotropic, NMDA 2B HNR3 NR3 Glutamate Receptor Subunit Epsilon-2 GluN2B(Alt_5'UTR) EIEE27 DEE27 MRD6
Location (GRCh38)
12:13437942-13982002
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000834.5
Sequence length
30609.0 nt
GC content
0.4374

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-9290.57 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000834.5 NCBI
ACUUCCUCCGGCUUCUUCACCUCUAGGAAAUCUCGGGGCUUCGCUCUAU… 30609 nt 0.4374
NM_001413992.1 NCBI
AUCCACCUUACCACCCCACUUCCCCAGCACAUGACGUGGGAAGCUGCCU… 30802 nt 0.4388
Summary

This gene encodes a member of the N-methyl-D-aspartate (NMDA) receptor family within the ionotropic glutamate receptor superfamily. The encoded protein is a subunit of the NMDA receptor ion channel which acts as an agonist binding site for glutamate. The NMDA receptors mediate a slow calcium-permeable component of excitatory synaptic transmission in the central nervous system. The NMDA receptors are heterotetramers of seven genetically encoded, differentially expressed subunits including NR1 (GRIN1), NR2 (GRIN2A, GRIN2B, GRIN2C, or GRIN2D) and NR3 (GRIN3A or GRIN3B). The early expression of this gene in development suggests a role in brain development, circuit formation, synaptic plasticity, and cellular migration and differentiation. Naturally occurring mutations within this gene are associated with neurodevelopmental disorders including autism spectrum disorder, attention deficit hyperactivity disorder, epilepsy, and schizophrenia. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the GRIN2B gene was a hub node and a prefrontal cortex differential wiring gene enriched in synapse part annotation, associated with context-induced reinstatement of methamphetamine seeking [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155]. In rats, the circular RNA circGrin2b, derived from the GRIN2B host gene, was significantly upregulated in the orbitofrontal cortex after heroin self-administration in both sexes, with its linear mRNA also upregulated in males, and this regulation was specific to heroin reward compared to sucrose [Floris et al. DOI:10.3390/ijms23031453].