Basic Information

Symbol
GRIN2C
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Ionotropic Receptor NMDA Type Subunit 2C GluN2C NR2C NMDAR2C Glutamate Receptor, Ionotropic, N-Methyl D-Aspartate 2C Glutamate [NMDA] Receptor Subunit Epsilon-3 N-Methyl D-Aspartate Receptor Subtype 2C Glutamate Receptor Ionotropic, NMDA 2C N-Methyl-D-Aspartate Receptor Subunit 2C Putative NMDtranscript(AltAcc_e11) Putative NMDtranscript(AltDon_e4) Putative NMDtranscript(Del_e4) GluN2C-B Alternative Isoform GluN2C(Alt_5'UTR_77nt) GluN2C(Alt_5'UTR_87nt) GluN2C(Del_e2)
Location (GRCh38)
17:74842022-74861767
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000835.6
Sequence length
4271.0 nt
GC content
0.6579

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2032.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2098.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1146.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000835.6 NCBI
GCAUCGCGAGUGUCCUUGAGCCGCGGGUGACGGUGGCUCUCGCUGCUCG… 4271 nt 0.6579
NM_001278553.2 NCBI
GCGAGUCCCGCUUCUUCCCCUUCCAGCUCUGCCCCAUCUCCUUUGCCCC… 3237 nt 0.6364
Summary

This gene encodes a subunit of the N-methyl-D-aspartate (NMDA) receptor, which is a subtype of ionotropic glutamate receptor. NMDA receptors are found in the central nervous system, are permeable to cations and have an important role in physiological processes such as learning, memory, and synaptic development. The receptor is a tetramer of different subunits (typically heterodimer of subunit 1 with one or more of subunits 2A-D), forming a channel that is permeable to calcium, potassium, and sodium, and whose properties are determined by subunit composition. Alterations in the subunit composition of the receptor are associated with pathophysiological conditions such as Parkinson's disease, Alzheimer's disease, depression, and schizophrenia. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2013]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the GRIN2C exhibited differential expression in the cerebellum, mediodorsal nucleus of the thalamus, and striatum compared to other brain regions [Enoch et al. DOI:10.1111/Gbb.12179].