Basic Information

Symbol
GRIN2D
RNA class
mRNA
Alias
Glutamate Ionotropic Receptor NMDA Type Subunit 2D GluN2D EB11 NR2D NMDAR2D Glutamate Receptor, Ionotropic, N-Methyl D-Aspartate 2D Glutamate [NMDA] Receptor Subunit Epsilon-4 N-Methyl-D-Aspartate Receptor Subunit 2D N-Methyl D-Aspartate Receptor Subtype 2D Glutamate Receptor Ionotropic, NMDA 2D Estrogen Receptor Binding CpG Island EIEE46 DEE46
Location (GRCh38)
19:48393668-48444931
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000836.4
Sequence length
5511.0 nt
GC content
0.6903

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2660.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2746.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1350.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000836.4 NCBI
AUCCCGAGUGAGUGUGUGUGUGCGAGAACACAGCGAGUGUGUGAGUCCC… 5511 nt 0.6903
Summary

N-methyl-D-aspartate (NMDA) receptors are a class of ionotropic glutamate receptors. NMDA channel has been shown to be involved in long-term potentiation, an activity-dependent increase in the efficiency of synaptic transmission thought to underlie certain kinds of memory and learning. NMDA receptor channels are heteromers composed of the key receptor subunit NMDAR1 (GRIN1) and 1 or more of the 4 NMDAR2 subunits: NMDAR2A (GRIN2A), NMDAR2B (GRIN2B), NMDAR2C (GRIN2C), and NMDAR2D (GRIN2D). [provided by RefSeq, Mar 2010]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the GRIN2D gene, encoding the GluN2D NMDA receptor subunit, was up-regulated in the hippocampus of alcoholics and down-regulated in cocaine addicts relative to controls, with a significant FDR-corrected P-value of 0.028 [Enoch et al. DOI:10.1111/Gbb.12179].